More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0798 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  99.47 
 
 
377 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0694  rare lipoprotein A  98.67 
 
 
377 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  99.47 
 
 
377 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  100 
 
 
377 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  98.94 
 
 
377 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  80.9 
 
 
362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  80.9 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  80.9 
 
 
362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  80.9 
 
 
362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  80.9 
 
 
362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  80.64 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  80.9 
 
 
362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  80.64 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  80.37 
 
 
362 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1168  rare lipoprotein A  77.31 
 
 
365 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  55 
 
 
360 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  55.26 
 
 
360 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
360 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  50.78 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  52.6 
 
 
361 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  51.79 
 
 
375 aa  338  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  50.25 
 
 
381 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  48.86 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  42.48 
 
 
267 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  31.07 
 
 
381 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  43.94 
 
 
263 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  37.64 
 
 
267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  26.74 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  33.73 
 
 
264 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  36.25 
 
 
265 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  44.83 
 
 
269 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  38.81 
 
 
260 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  36.94 
 
 
293 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  39.55 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  41.36 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  35.09 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  35.39 
 
 
297 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  41.42 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  35 
 
 
270 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  45.61 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
260 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  41.8 
 
 
278 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.24 
 
 
286 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.86 
 
 
295 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  32.72 
 
 
367 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  40.24 
 
 
314 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  33.86 
 
 
337 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
424 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  33.7 
 
 
277 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  33.7 
 
 
277 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  33.89 
 
 
277 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  37.86 
 
 
277 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  37.14 
 
 
283 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  45.22 
 
 
394 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  38.13 
 
 
280 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  37.86 
 
 
280 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  37.86 
 
 
280 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  39.19 
 
 
364 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  29.61 
 
 
281 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  30.75 
 
 
409 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  36.11 
 
 
333 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  45.22 
 
 
283 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  39.19 
 
 
364 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  43.36 
 
 
408 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
423 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  35.2 
 
 
332 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  31.64 
 
 
346 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  36.36 
 
 
312 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  41.54 
 
 
333 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  27.58 
 
 
419 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  37.28 
 
 
312 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  27.58 
 
 
421 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  34.27 
 
 
415 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  43.24 
 
 
442 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  28.09 
 
 
322 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  34.27 
 
 
417 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  44.04 
 
 
398 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  36.92 
 
 
322 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  38.41 
 
 
186 aa  99.4  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  34.59 
 
 
342 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  42.98 
 
 
341 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  45.19 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  45.19 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  37.41 
 
 
311 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  40 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.51 
 
 
342 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  41.44 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  40.19 
 
 
273 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  42.73 
 
 
394 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  34.73 
 
 
284 aa  96.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
310 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  43.18 
 
 
339 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  32.61 
 
 
273 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  38.79 
 
 
257 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  45.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  41.28 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  42.64 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  37.93 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  42.02 
 
 
279 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  39.82 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>