More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0618 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  99.72 
 
 		 362 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  99.45 
 
 		 362 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  99.72 
 
 		 362 aa  725    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  99.45 
 
 		 362 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  99.17 
 
 		 362 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  99.72 
 
 		 362 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  99.72 
 
 		 362 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  100 
 
 		 362 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  99.72 
 
 		 362 aa  725    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  79.47 
 
 		 377 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  79.47 
 
 		 377 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  80.11 
 
 		 377 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  78.95 
 
 		 377 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0694  rare lipoprotein A  79.31 
 
 		 377 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1168  rare lipoprotein A  77.87 
 
 		 365 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  53.8 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  53.8 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  53.39 
 
 		 361 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  53.13 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  51.85 
 
 		 375 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  50 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  49.87 
 
 		 381 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  48.32 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  40.44 
 
 		 267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  39.44 
 
 		 267 aa  126  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  32.43 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  41.91 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  38.12 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  30.14 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  37.66 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  33.92 
 
 		 265 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  38.51 
 
 		 260 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  37.11 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  38.97 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  26.89 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  30.32 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  33.03 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  44.36 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  36.63 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  30.57 
 
 		 415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  28.88 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  26.02 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  34.86 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  50.49 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.24 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  35.91 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  35.2 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  35.2 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  35.2 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  30.55 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  34.64 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  45.69 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  37.36 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  37.31 
 
 		 280 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  37.31 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  37.88 
 
 		 280 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  27.04 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  37.12 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  48.57 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  34.46 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  48.11 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  38.95 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  49.04 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  29.74 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  33.5 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  45.95 
 
 		 283 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  37.91 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  39.57 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  35.56 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  42.42 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.13 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  49.5 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  43.97 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  49.5 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  36.26 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  36.67 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  44.25 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 186 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  34.18 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  43.36 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  45.95 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  44.74 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  30.58 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  43.86 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  38.18 
 
 		 312 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  35.16 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  37.84 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  37.84 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  37.65 
 
 		 281 aa  97.8  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  33.54 
 
 		 273 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  43.1 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  42.57 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  43.59 
 
 		 310 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  39.67 
 
 		 194 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  44.35 
 
 		 282 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.52 
 
 		 257 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>