More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2228 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  75.92 
 
 		 195 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  54.91 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  67.16 
 
 		 169 aa  187  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  54.14 
 
 		 171 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  64.75 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  57.52 
 
 		 163 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 333 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  43.55 
 
 		 333 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 333 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  48.99 
 
 		 322 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  41.33 
 
 		 342 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  40.1 
 
 		 277 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  40.1 
 
 		 277 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.33 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  59.02 
 
 		 342 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  59.02 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  40.1 
 
 		 277 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  40.1 
 
 		 277 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  58.2 
 
 		 325 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  50 
 
 		 335 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  43.55 
 
 		 337 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  42.93 
 
 		 332 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  42.01 
 
 		 280 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  39.06 
 
 		 281 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  42.01 
 
 		 280 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  42.01 
 
 		 280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  42.94 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  42.78 
 
 		 474 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  49.3 
 
 		 281 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 468 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  48.44 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 455 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  54.31 
 
 		 314 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 367 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  43.12 
 
 		 260 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  43.32 
 
 		 312 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  40.66 
 
 		 265 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  51.26 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  41.76 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  42.07 
 
 		 265 aa  121  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  54.33 
 
 		 143 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  55.08 
 
 		 314 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  52.03 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  39.34 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  52.1 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  36.73 
 
 		 375 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.9 
 
 		 297 aa  118  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.39 
 
 		 339 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  38.89 
 
 		 264 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  51.69 
 
 		 421 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  51.69 
 
 		 419 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 315 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.03 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  52.54 
 
 		 283 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 424 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 295 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  53.39 
 
 		 312 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  36.73 
 
 		 370 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  48.74 
 
 		 341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  38.97 
 
 		 297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 282 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  38.22 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.38 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 361 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.38 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  47.2 
 
 		 259 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 361 aa  111  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.38 
 
 		 266 aa  111  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  46.67 
 
 		 361 aa  111  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  42.42 
 
 		 285 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  50.85 
 
 		 408 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 279 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  48.76 
 
 		 286 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 383 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  38.22 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 360 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  40 
 
 		 274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  45.53 
 
 		 270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  39.63 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50.85 
 
 		 238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  49.59 
 
 		 382 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  40 
 
 		 274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 322 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 398 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 394 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  44.12 
 
 		 381 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  43.17 
 
 		 417 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 415 aa  107  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  49.15 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  37.1 
 
 		 318 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  37.14 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>