More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1940 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  100 
 
 		 163 aa  336  9e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  69.48 
 
 		 154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  61.76 
 
 		 171 aa  214  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  63.29 
 
 		 169 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  73.33 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  57.52 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  48.9 
 
 		 195 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  56.8 
 
 		 335 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  54.4 
 
 		 342 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.33 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.2 
 
 		 341 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  53.6 
 
 		 342 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  46.63 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52 
 
 		 332 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  51.2 
 
 		 325 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 474 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52 
 
 		 333 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 455 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  52 
 
 		 333 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  39.01 
 
 		 337 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  52 
 
 		 333 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  50.42 
 
 		 282 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 339 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 468 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  42.58 
 
 		 367 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  37.82 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  50 
 
 		 314 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  52.5 
 
 		 442 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  51.15 
 
 		 314 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  47.41 
 
 		 322 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  51.2 
 
 		 312 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 314 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  42 
 
 		 318 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  49.59 
 
 		 311 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  47.48 
 
 		 417 aa  114  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  47.29 
 
 		 315 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  44.08 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 312 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  42.48 
 
 		 259 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  46.76 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  41.22 
 
 		 243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  48.33 
 
 		 297 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  41.42 
 
 		 264 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 279 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  40.94 
 
 		 265 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  42.5 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  47.29 
 
 		 260 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  46.43 
 
 		 281 aa  110  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  49.25 
 
 		 278 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 361 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  47.9 
 
 		 361 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.51 
 
 		 283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  45.9 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.77 
 
 		 293 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  38.51 
 
 		 286 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 398 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 265 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  47.2 
 
 		 246 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  47.24 
 
 		 238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  40.24 
 
 		 267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  37.74 
 
 		 270 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  39.29 
 
 		 267 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 280 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 270 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  47.46 
 
 		 286 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.2 
 
 		 408 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 280 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  46.77 
 
 		 254 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 277 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  49.59 
 
 		 382 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 394 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  40.91 
 
 		 255 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0279  Rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000131021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 277 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  39.88 
 
 		 375 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 277 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 322 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 277 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 283 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  45.76 
 
 		 240 aa  104  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 275 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 275 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 266 aa  104  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  48.44 
 
 		 341 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  39.31 
 
 		 370 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  52.58 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  42.66 
 
 		 424 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  46.22 
 
 		 264 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  36.88 
 
 		 279 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 310 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  48.76 
 
 		 290 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 423 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 321 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  51 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  43.41 
 
 		 346 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  38.32 
 
 		 258 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>