More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2450 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  72.9 
 
 
154 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  69.41 
 
 
169 aa  240  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  61.76 
 
 
163 aa  214  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  71.85 
 
 
169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
195 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  54.14 
 
 
194 aa  187  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  46.63 
 
 
322 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  47.74 
 
 
367 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  43.79 
 
 
339 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  53.28 
 
 
341 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  53.28 
 
 
342 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  50 
 
 
282 aa  118  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  40.51 
 
 
337 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  38.69 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  45.75 
 
 
335 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  50 
 
 
474 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  49.61 
 
 
314 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  48.84 
 
 
312 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  50 
 
 
455 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  44.44 
 
 
342 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  44.57 
 
 
318 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
322 aa  114  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
342 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  40.76 
 
 
270 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
265 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  51.64 
 
 
332 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  49.21 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  48.84 
 
 
312 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  51.64 
 
 
325 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
277 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  44.57 
 
 
265 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  48.39 
 
 
259 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  51.64 
 
 
333 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  48.06 
 
 
315 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  47.93 
 
 
259 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  40.11 
 
 
281 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  50.41 
 
 
382 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  48 
 
 
442 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
277 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
277 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
277 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.64 
 
 
333 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.64 
 
 
333 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
280 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
249 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
314 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
280 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
280 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  47.29 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  50 
 
 
297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  51.59 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  46.97 
 
 
275 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.28 
 
 
243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  46.97 
 
 
275 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
283 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
295 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  48.06 
 
 
279 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  49.6 
 
 
314 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  46.97 
 
 
266 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  47.29 
 
 
283 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  48.84 
 
 
321 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  44 
 
 
361 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  44 
 
 
361 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  41.67 
 
 
270 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
311 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  42.31 
 
 
264 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  40.88 
 
 
286 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  47.54 
 
 
143 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  48.72 
 
 
274 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
281 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  48.72 
 
 
274 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  46.83 
 
 
341 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  42.45 
 
 
264 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  47.06 
 
 
240 aa  105  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  46.72 
 
 
238 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  47.15 
 
 
254 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  53 
 
 
206 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  47.5 
 
 
278 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  52.34 
 
 
303 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53 
 
 
206 aa  104  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  40.61 
 
 
284 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  48.74 
 
 
258 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  48.72 
 
 
273 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  43.12 
 
 
186 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0279  Rare lipoprotein A  45.83 
 
 
172 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000131021  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  37.5 
 
 
279 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  42.57 
 
 
408 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  37.22 
 
 
424 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  43.9 
 
 
286 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  47.86 
 
 
273 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  47.11 
 
 
421 aa  101  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  47.11 
 
 
419 aa  101  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  39.58 
 
 
239 aa  100  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  45 
 
 
364 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  38.24 
 
 
367 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  43.09 
 
 
383 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  38.38 
 
 
267 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  37.84 
 
 
260 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  49.15 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>