More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2697 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  69.41 
 
 		 171 aa  240  6e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  73.2 
 
 		 154 aa  237  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  67.68 
 
 		 169 aa  224  4e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  63.29 
 
 		 163 aa  210  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  67.16 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  64.44 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  52.45 
 
 		 342 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  52.45 
 
 		 341 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 322 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  44.19 
 
 		 318 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  49.65 
 
 		 342 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 367 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  48.95 
 
 		 335 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  54.84 
 
 		 325 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  54.03 
 
 		 337 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  48.95 
 
 		 342 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  42.17 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  41.99 
 
 		 312 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 474 aa  117  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 455 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  48.76 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  43.79 
 
 		 314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 442 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 339 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 468 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 332 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  41.77 
 
 		 240 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  40.88 
 
 		 281 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0279  Rare lipoprotein A  42.6 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000131021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 266 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 333 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  46.15 
 
 		 333 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  47.29 
 
 		 314 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  48.74 
 
 		 282 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 277 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  41.98 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 333 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  48.41 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.77 
 
 		 258 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  38.33 
 
 		 315 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.19 
 
 		 286 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  50 
 
 		 265 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 280 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 280 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 280 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  41.28 
 
 		 249 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 259 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  45.74 
 
 		 279 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  45.38 
 
 		 314 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 278 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  39.77 
 
 		 312 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 243 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 322 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  43.24 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  48.06 
 
 		 321 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 281 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  40.76 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  40.76 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  45.6 
 
 		 361 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  45.6 
 
 		 361 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  39.11 
 
 		 297 aa  104  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 311 aa  104  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 382 aa  103  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  40.85 
 
 		 264 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 295 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  45.9 
 
 		 310 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  44.2 
 
 		 279 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  43.88 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  37.21 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  40.54 
 
 		 239 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  44.96 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  39.88 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  45.39 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  41.86 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  47.15 
 
 		 270 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  48.41 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  46.67 
 
 		 273 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  50 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  50 
 
 		 206 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  38.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  40.8 
 
 		 264 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  46.15 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  45.83 
 
 		 421 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  39.11 
 
 		 267 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  36.78 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  45.83 
 
 		 419 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  36.78 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  41.91 
 
 		 246 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  42.4 
 
 		 381 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 324 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>