More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1818 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 361 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  57.58 
 
 		 361 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  54.17 
 
 		 143 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  34.62 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  34.62 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  37.55 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40.09 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  37.55 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  40.87 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  40.36 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  36.96 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  34.54 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  34.75 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  34.48 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  37.39 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  35.41 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  34.84 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  40.49 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  35.32 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  37.21 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  37.21 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  33.99 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  31.35 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  36.16 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  31.18 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  37.3 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  35.77 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  30.5 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  33.48 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  33.48 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  35.55 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  33.48 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  33.33 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  34.22 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  34.39 
 
 		 341 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.7 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.92 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  30.63 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.49 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  31.56 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  31.56 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  34.06 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  35.82 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 169 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 381 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  35.84 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  31.08 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  40.31 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  30.77 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  32.39 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  34.96 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  36.82 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  34.96 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  31.23 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  37.44 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  31.11 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  34.43 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  33.06 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  35.98 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  38.54 
 
 		 195 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  45.65 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  36 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  32.33 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 367 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  31.94 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  34.07 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 423 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  33.09 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  38.96 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  40.25 
 
 		 169 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  48.67 
 
 		 415 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  34.39 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  43.51 
 
 		 185 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  48.67 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  34.2 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  34.72 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  32.01 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  34.02 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 394 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  48.65 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  37.11 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  35.4 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  37.11 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  32.38 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  38.65 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50.94 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  37.11 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  42.86 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  29.46 
 
 		 337 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  49.56 
 
 		 367 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  39.16 
 
 		 360 aa  99.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  46.3 
 
 		 160 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  46.3 
 
 		 160 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>