96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2754 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  56.2 
 
 		 785 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  53.43 
 
 		 783 aa  816    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  65.56 
 
 		 781 aa  1011    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  56.13 
 
 		 772 aa  847    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  53.43 
 
 		 783 aa  816    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  56.13 
 
 		 772 aa  847    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  58.58 
 
 		 793 aa  839    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  52.89 
 
 		 773 aa  788    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  53.27 
 
 		 802 aa  830    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  52.88 
 
 		 773 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  50.2 
 
 		 743 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  48.98 
 
 		 781 aa  704    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  49.5 
 
 		 788 aa  684    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  48.72 
 
 		 777 aa  793    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  100 
 
 		 778 aa  1580    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  52.44 
 
 		 773 aa  734    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  56.15 
 
 		 785 aa  888    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  55.61 
 
 		 786 aa  867    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  36.19 
 
 		 757 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  37.52 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  37.52 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  36.26 
 
 		 773 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 		 756 aa  466  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  36.68 
 
 		 749 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  31.29 
 
 		 769 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  39.86 
 
 		 852 aa  227  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.64 
 
 		 517 aa  224  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  35.03 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  38.75 
 
 		 842 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  39.52 
 
 		 805 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  39.52 
 
 		 831 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 578 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 1006 aa  193  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  33.55 
 
 		 913 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  37.79 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  39.25 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  34.01 
 
 		 607 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.33 
 
 		 705 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  38.91 
 
 		 689 aa  169  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 		 532 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.64 
 
 		 631 aa  168  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  35.33 
 
 		 644 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 		 633 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  35.55 
 
 		 638 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  35.33 
 
 		 614 aa  164  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  33.62 
 
 		 650 aa  161  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.84 
 
 		 562 aa  160  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  34.98 
 
 		 624 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  33.91 
 
 		 633 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  33.56 
 
 		 633 aa  157  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  35.15 
 
 		 645 aa  157  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  35.18 
 
 		 612 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  37.39 
 
 		 618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  31.4 
 
 		 519 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  30.56 
 
 		 637 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 		 647 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.77 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  34.45 
 
 		 612 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  34.33 
 
 		 624 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  33.78 
 
 		 647 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  34.33 
 
 		 624 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 		 677 aa  144  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  34.45 
 
 		 612 aa  141  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  33.57 
 
 		 674 aa  137  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  29.84 
 
 		 564 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  31.82 
 
 		 576 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  33.67 
 
 		 571 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 571 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 571 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 		 570 aa  111  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 		 570 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 		 570 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  28.91 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 510 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  27.93 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  27.93 
 
 		 510 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  27.93 
 
 		 510 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.23 
 
 		 510 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  31.32 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.77 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  28.3 
 
 		 584 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  29.25 
 
 		 612 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.81 
 
 		 598 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 		 634 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 572 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  26.26 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  26.26 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 696 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 		 638 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.27 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 		 547 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 		 547 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>