46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3435 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  99.45 
 
 		 547 aa  1123    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 547 aa  1128    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  44.57 
 
 		 533 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 		 572 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 		 584 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  34.2 
 
 		 575 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.65 
 
 		 598 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  35.34 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 662 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  31.07 
 
 		 696 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  23.62 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  23.44 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  32.3 
 
 		 753 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  36.07 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  28.21 
 
 		 567 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  30.88 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  23.14 
 
 		 563 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1234  hypothetical protein  46 
 
 		 84 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  22.98 
 
 		 635 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.75 
 
 		 645 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  26.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  22.94 
 
 		 757 aa  47.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  26.27 
 
 		 769 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  26.8 
 
 		 633 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.71 
 
 		 631 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 		 427 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  25.68 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.2 
 
 		 634 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  25.26 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  26.74 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  23.45 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  26.74 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.32 
 
 		 637 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  31.13 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.51 
 
 		 633 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.29 
 
 		 634 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.01 
 
 		 633 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.29 
 
 		 631 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.29 
 
 		 631 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  27.98 
 
 		 610 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>