86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1979 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
647 aa  1339    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  41.17 
 
 
618 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  41.29 
 
 
607 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  39.97 
 
 
612 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  39.29 
 
 
614 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  41.19 
 
 
612 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  41.51 
 
 
612 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  36.49 
 
 
637 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  36.91 
 
 
618 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 
633 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  32.04 
 
 
636 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  30.73 
 
 
633 aa  279  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  30.64 
 
 
633 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  30.95 
 
 
624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 
631 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  29.88 
 
 
647 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  31.3 
 
 
552 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  29.41 
 
 
645 aa  262  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  30.35 
 
 
624 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 
650 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  29.78 
 
 
624 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  28.66 
 
 
637 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  29 
 
 
644 aa  238  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  29.74 
 
 
638 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  36.27 
 
 
689 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  36.27 
 
 
689 aa  190  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  36.24 
 
 
852 aa  184  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  34.25 
 
 
705 aa  178  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  33.78 
 
 
677 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 
842 aa  173  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  31.06 
 
 
674 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  34.08 
 
 
1006 aa  161  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 
831 aa  160  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  32.87 
 
 
805 aa  160  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  31.54 
 
 
773 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 
773 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 
777 aa  144  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 
756 aa  143  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 
759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  30.59 
 
 
759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  29.59 
 
 
783 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
783 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  31.51 
 
 
793 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
772 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  29.59 
 
 
772 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  35.23 
 
 
913 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 
749 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  33.77 
 
 
743 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 
781 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  33.11 
 
 
778 aa  134  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
773 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  28.52 
 
 
785 aa  133  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  29.51 
 
 
786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  34.62 
 
 
610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  32.43 
 
 
564 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  30.99 
 
 
773 aa  130  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 
781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  30.34 
 
 
785 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 
802 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  29.54 
 
 
757 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 
570 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 
570 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 
570 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 
788 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
578 aa  122  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  32.08 
 
 
769 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 
766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  34.19 
 
 
605 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  27.92 
 
 
517 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  31.75 
 
 
570 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 
576 aa  104  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  25.51 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  25.51 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  25.51 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.19 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  24.75 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  25.91 
 
 
510 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 
532 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  24.11 
 
 
519 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 
638 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 
634 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  28.65 
 
 
627 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  33.78 
 
 
629 aa  43.9  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>