27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4733 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 696 aa  1403    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 		 628 aa  137  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 		 753 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  25.59 
 
 		 662 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.71 
 
 		 598 aa  124  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  32.35 
 
 		 572 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 617 aa  98.6  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  26.61 
 
 		 575 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 533 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  27.82 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 518 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  25.72 
 
 		 644 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 		 547 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  31.55 
 
 		 547 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  25.82 
 
 		 601 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  27.96 
 
 		 490 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  25.49 
 
 		 584 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  25.76 
 
 		 773 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  24.87 
 
 		 766 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3253  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 634 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0206278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 756 aa  46.6  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  32.74 
 
 		 644 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  24.22 
 
 		 3242 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>