56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4064 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 584 aa  1202    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.44 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 		 572 aa  226  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 		 572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 547 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 615 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  25.51 
 
 		 575 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  25.08 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  24.04 
 
 		 662 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  32.74 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  31.98 
 
 		 753 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 696 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  25.87 
 
 		 644 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  24.06 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  26.07 
 
 		 625 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  25.75 
 
 		 619 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  25.75 
 
 		 619 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.47 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  26.17 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3253  von Willebrand factor type A  29.07 
 
 		 634 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0206278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  26.12 
 
 		 619 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.67 
 
 		 631 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.43 
 
 		 631 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.75 
 
 		 620 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.74 
 
 		 631 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.09 
 
 		 612 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.9 
 
 		 632 aa  51.2  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  23.45 
 
 		 633 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  23.28 
 
 		 788 aa  50.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 582 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  23.91 
 
 		 631 aa  48.5  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.73 
 
 		 631 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  33.96 
 
 		 584 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.19 
 
 		 633 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  27.38 
 
 		 580 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.57 
 
 		 638 aa  47.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  25.98 
 
 		 577 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  23.44 
 
 		 633 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.32 
 
 		 644 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.46 
 
 		 630 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.89 
 
 		 634 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  27.75 
 
 		 573 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.63 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  25.37 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  28.48 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.34 
 
 		 640 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.07 
 
 		 604 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  26.86 
 
 		 610 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.88 
 
 		 634 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.32 
 
 		 622 aa  44.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  24.29 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.05 
 
 		 633 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  22.76 
 
 		 607 aa  43.9  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>