40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0210 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  92.81 
 
 		 572 aa  1070    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 572 aa  1177    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  36.86 
 
 		 575 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.42 
 
 		 598 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  29.48 
 
 		 584 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 		 547 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 		 547 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  30.35 
 
 		 615 aa  197  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  27.73 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  25.78 
 
 		 617 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  31.36 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  36 
 
 		 533 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 		 696 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  25 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  23.91 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  24.28 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 		 753 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  26.98 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  24.02 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  27.01 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  29.5 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.59 
 
 		 647 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 781 aa  51.6  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  23.36 
 
 		 635 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.71 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  22.82 
 
 		 769 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  20.48 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  28.35 
 
 		 777 aa  47.4  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  32.5 
 
 		 781 aa  47.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 		 783 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  23.83 
 
 		 783 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2996  Zn-dependent peptidase  26.34 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  20.06 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  21.22 
 
 		 631 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  20.35 
 
 		 633 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 773 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  25.19 
 
 		 773 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  23.79 
 
 		 599 aa  43.9  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>