18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1516 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  100 
 
 
520 aa  1066    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 
753 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  25.24 
 
 
785 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
572 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  31.21 
 
 
769 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  30.92 
 
 
572 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  24.76 
 
 
785 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  26.12 
 
 
477 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  27.56 
 
 
786 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
756 aa  47.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  29.14 
 
 
773 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  25 
 
 
781 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  27.42 
 
 
547 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  27.42 
 
 
547 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  23.64 
 
 
757 aa  44.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  22.33 
 
 
783 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  22.33 
 
 
783 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 
615 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>