22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5217 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
753 aa  1501    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 
696 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 
617 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 
615 aa  84.7  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  33.5 
 
 
533 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  31.98 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.42 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  24.42 
 
 
628 aa  70.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  23.11 
 
 
662 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  27.27 
 
 
575 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  32.3 
 
 
547 aa  61.6  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  32.3 
 
 
547 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  27.93 
 
 
490 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  27.5 
 
 
584 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 
518 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 
582 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  27.35 
 
 
601 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 
520 aa  52.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.29 
 
 
620 aa  48.5  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  35.85 
 
 
625 aa  44.3  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>