60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3732 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
662 aa  1362    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  47.14 
 
 
518 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
572 aa  190  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  28.5 
 
 
572 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  25.97 
 
 
575 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.76 
 
 
598 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  25.87 
 
 
696 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 
615 aa  114  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  27.58 
 
 
584 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  23.17 
 
 
628 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
547 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  30.83 
 
 
547 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  21.74 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  30.21 
 
 
533 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  27.52 
 
 
788 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  27.14 
 
 
584 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  24.8 
 
 
582 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  26.28 
 
 
624 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
627 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  28.4 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  28.4 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  28.4 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.4 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  28.4 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  25.74 
 
 
619 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  28.99 
 
 
627 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  28.82 
 
 
627 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  28.82 
 
 
627 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  29.05 
 
 
734 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  27.43 
 
 
633 aa  51.6  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 
627 aa  51.2  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.81 
 
 
622 aa  51.2  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  23.43 
 
 
753 aa  50.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  28.4 
 
 
627 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 
636 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  23.68 
 
 
631 aa  49.3  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.7 
 
 
631 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.63 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  25.71 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  27.16 
 
 
567 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.11 
 
 
637 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  24.54 
 
 
625 aa  47.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  27.11 
 
 
637 aa  47.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.79 
 
 
634 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.78 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  26.09 
 
 
633 aa  47.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 
638 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.82 
 
 
632 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.59 
 
 
633 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.59 
 
 
633 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
382 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.72 
 
 
635 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.75 
 
 
636 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.76 
 
 
640 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.72 
 
 
635 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.68 
 
 
638 aa  45.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
599 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  26.13 
 
 
633 aa  44.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  24.73 
 
 
626 aa  44.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  24.93 
 
 
601 aa  43.9  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>