38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0391 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1229    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  27 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.74 
 
 		 598 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  24.7 
 
 		 572 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  24.12 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 		 547 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 		 584 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  25.72 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  23.05 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  22.93 
 
 		 628 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  27.35 
 
 		 753 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  28.16 
 
 		 785 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  30.3 
 
 		 785 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  25.42 
 
 		 533 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  24.31 
 
 		 662 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  24.08 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  24.08 
 
 		 619 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  24.08 
 
 		 625 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  24.08 
 
 		 619 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.16 
 
 		 622 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  30.39 
 
 		 631 aa  47.4  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.25 
 
 		 635 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.25 
 
 		 635 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.68 
 
 		 636 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.49 
 
 		 620 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.05 
 
 		 630 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  27.91 
 
 		 2035 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 		 772 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  30.5 
 
 		 772 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  37.88 
 
 		 622 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.53 
 
 		 632 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  29.77 
 
 		 743 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.31 
 
 		 634 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  23.67 
 
 		 626 aa  43.5  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>