71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3553 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 		 635 aa  1279    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  68.59 
 
 		 644 aa  856    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.67 
 
 		 631 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  62.68 
 
 		 633 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.2 
 
 		 631 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.92 
 
 		 632 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  84.49 
 
 		 632 aa  1034    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 		 635 aa  1279    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  53.22 
 
 		 631 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  68.01 
 
 		 645 aa  844    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  68.23 
 
 		 633 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  64.91 
 
 		 637 aa  764    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.23 
 
 		 612 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.53 
 
 		 637 aa  827    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.66 
 
 		 631 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.59 
 
 		 637 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.33 
 
 		 638 aa  735    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.68 
 
 		 640 aa  833    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  62 
 
 		 633 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  64.38 
 
 		 633 aa  761    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.45 
 
 		 634 aa  831    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.04 
 
 		 633 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  97.91 
 
 		 636 aa  1182    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  68.9 
 
 		 635 aa  847    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.25 
 
 		 647 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  83.36 
 
 		 630 aa  1055    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  83.62 
 
 		 634 aa  1052    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.56 
 
 		 631 aa  841    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.09 
 
 		 633 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.22 
 
 		 620 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.33 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  53.08 
 
 		 626 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  53.55 
 
 		 624 aa  608  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.47 
 
 		 604 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  51.82 
 
 		 625 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.51 
 
 		 622 aa  599  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  53.72 
 
 		 607 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  52.32 
 
 		 633 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  52.9 
 
 		 619 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  52.9 
 
 		 619 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  52.13 
 
 		 619 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  51.31 
 
 		 622 aa  528  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  33.39 
 
 		 563 aa  268  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  33.57 
 
 		 577 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31.81 
 
 		 577 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  33.33 
 
 		 574 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  33.22 
 
 		 578 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  31.84 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  32.23 
 
 		 573 aa  213  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  37.75 
 
 		 573 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  32.47 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  30.4 
 
 		 788 aa  94.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  32.2 
 
 		 567 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  28.81 
 
 		 533 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  26.6 
 
 		 599 aa  51.6  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  22.71 
 
 		 628 aa  50.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  22.71 
 
 		 628 aa  50.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  25.88 
 
 		 629 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 634 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  23.68 
 
 		 601 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  26.72 
 
 		 662 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 		 802 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  23.78 
 
 		 626 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  23.78 
 
 		 626 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  23.78 
 
 		 626 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.78 
 
 		 626 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  23.78 
 
 		 626 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  23.78 
 
 		 627 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 		 627 aa  43.9  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>