54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2614 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 533 aa  1089    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  44.61 
 
 		 547 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  44.57 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 584 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  29.34 
 
 		 575 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.99 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  35.12 
 
 		 572 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  23.65 
 
 		 617 aa  104  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  24.4 
 
 		 518 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  33.5 
 
 		 753 aa  80.1  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 		 628 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  23.33 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1234  hypothetical protein  63.04 
 
 		 84 aa  67  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  24.16 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  25.86 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  25.45 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.41 
 
 		 634 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.84 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.41 
 
 		 640 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.84 
 
 		 630 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  36.63 
 
 		 644 aa  54.7  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.81 
 
 		 636 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.81 
 
 		 635 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.81 
 
 		 635 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.84 
 
 		 637 aa  51.2  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  27.84 
 
 		 633 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.7 
 
 		 633 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.7 
 
 		 633 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  27.84 
 
 		 637 aa  50.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  28.41 
 
 		 633 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.14 
 
 		 644 aa  50.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.84 
 
 		 634 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.25 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  27.84 
 
 		 635 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.84 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  26.7 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.38 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.57 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  27.12 
 
 		 625 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.14 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.81 
 
 		 631 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.81 
 
 		 631 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.7 
 
 		 637 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  25.4 
 
 		 622 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  24.12 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  25 
 
 		 607 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  26.59 
 
 		 631 aa  44.3  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  25 
 
 		 604 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  28.14 
 
 		 633 aa  44.3  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>