38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2161 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1183    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  37.67 
 
 		 572 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  37.07 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.44 
 
 		 598 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  30.3 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  27.26 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  26.08 
 
 		 662 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  25.66 
 
 		 584 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 		 615 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 		 628 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 547 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  26.07 
 
 		 601 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 		 696 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  27.03 
 
 		 644 aa  93.6  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 		 753 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  27.34 
 
 		 567 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  25.79 
 
 		 788 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  22.85 
 
 		 627 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  24.14 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1557  VWA containing CoxE-like protein  25.81 
 
 		 381 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0310279  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  24.03 
 
 		 627 aa  48.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.59 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  25.59 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  26.47 
 
 		 627 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  25.59 
 
 		 627 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  26.47 
 
 		 627 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  24.33 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6233  VWA containing CoxE family protein  26.21 
 
 		 375 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  23.25 
 
 		 785 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  25.12 
 
 		 627 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  23.43 
 
 		 490 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1423  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 599 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2255  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.52 
 
 		 378 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>