69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1711 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 
622 aa  1231    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.98 
 
 
638 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.1 
 
 
633 aa  687    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  54.55 
 
 
633 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.52 
 
 
647 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.71 
 
 
632 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.26 
 
 
631 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.63 
 
 
636 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  54.87 
 
 
633 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.26 
 
 
631 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.54 
 
 
630 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.56 
 
 
633 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.15 
 
 
634 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.3 
 
 
635 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.41 
 
 
637 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.3 
 
 
635 aa  621  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.65 
 
 
640 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.95 
 
 
634 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.52 
 
 
631 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  55.17 
 
 
637 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  55.17 
 
 
633 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.35 
 
 
633 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.11 
 
 
631 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.37 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  54.49 
 
 
635 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.35 
 
 
637 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  54.34 
 
 
633 aa  611  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.53 
 
 
644 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.23 
 
 
612 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.33 
 
 
620 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.64 
 
 
633 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.27 
 
 
632 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  52.21 
 
 
625 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  52.52 
 
 
619 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  52.45 
 
 
619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  52.45 
 
 
619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  48.26 
 
 
631 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  51.53 
 
 
624 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  51.57 
 
 
607 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.33 
 
 
604 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  50.57 
 
 
626 aa  551  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  49.11 
 
 
622 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  35.22 
 
 
577 aa  261  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  33.72 
 
 
563 aa  260  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  33.45 
 
 
578 aa  230  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  32.6 
 
 
574 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31.2 
 
 
577 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  32.05 
 
 
610 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  33.03 
 
 
573 aa  207  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  37.42 
 
 
573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
582 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  33.21 
 
 
584 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  32.78 
 
 
567 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  26.93 
 
 
788 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  27.78 
 
 
599 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  24.81 
 
 
662 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.27 
 
 
628 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.27 
 
 
628 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  24.16 
 
 
601 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  24.86 
 
 
627 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
618 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  24.86 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  24.86 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.86 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  24.86 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  24.86 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 
584 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 
627 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
634 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>