25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4273 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 617 aa  1263    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 		 572 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  25.78 
 
 		 572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.97 
 
 		 598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  25.08 
 
 		 584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 		 628 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  25.16 
 
 		 575 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 		 753 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 533 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 696 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 		 615 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  21.74 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  24.76 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3253  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 		 634 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0206278 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  29.78 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  25.11 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  23.31 
 
 		 582 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  23.68 
 
 		 584 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  31.87 
 
 		 644 aa  44.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 636 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 		 759 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  28.35 
 
 		 759 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>