22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1891 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
518 aa  1068    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  45.71 
 
 
662 aa  269  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  27.54 
 
 
575 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
572 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  24.09 
 
 
572 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.15 
 
 
598 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 
547 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  24 
 
 
584 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 
547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  25.05 
 
 
533 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 
615 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 
696 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
617 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  23.82 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  26.22 
 
 
584 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  25 
 
 
788 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 
582 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2996  Zn-dependent peptidase  23.11 
 
 
315 aa  50.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 
753 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  26.27 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  27.65 
 
 
563 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>