61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2719 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.52 
 
 		 631 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.17 
 
 		 631 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  77.69 
 
 		 625 aa  939    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  78.05 
 
 		 619 aa  924    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  77.56 
 
 		 619 aa  916    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  78.05 
 
 		 619 aa  924    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  100 
 
 		 624 aa  1268    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  77.71 
 
 		 626 aa  939    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.83 
 
 		 638 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  73.08 
 
 		 620 aa  920    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.71 
 
 		 647 aa  632  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.84 
 
 		 644 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.06 
 
 		 632 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.8 
 
 		 637 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.93 
 
 		 631 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  51.51 
 
 		 633 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  53.63 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  54.05 
 
 		 633 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  54.05 
 
 		 637 aa  619  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.02 
 
 		 640 aa  621  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.05 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.42 
 
 		 634 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.65 
 
 		 633 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.58 
 
 		 645 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.28 
 
 		 635 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.84 
 
 		 633 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.28 
 
 		 635 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.15 
 
 		 632 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.57 
 
 		 612 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  54.55 
 
 		 633 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.54 
 
 		 633 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.53 
 
 		 631 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.66 
 
 		 636 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.49 
 
 		 637 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.1 
 
 		 634 aa  601  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  52.05 
 
 		 607 aa  571  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.24 
 
 		 604 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.96 
 
 		 622 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  47.03 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.47 
 
 		 633 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  48.97 
 
 		 633 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  60.84 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  33.89 
 
 		 577 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  31.57 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  32.52 
 
 		 574 aa  228  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31.59 
 
 		 577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  31.15 
 
 		 578 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  31.88 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  32.3 
 
 		 573 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  36.8 
 
 		 573 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  34.97 
 
 		 567 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  30.9 
 
 		 584 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  31.02 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  27.17 
 
 		 788 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 		 584 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  26.28 
 
 		 662 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  28.78 
 
 		 599 aa  53.9  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  28.69 
 
 		 753 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 615 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  26.42 
 
 		 629 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 634 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>