64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0109 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  100 
 
 		 788 aa  1614    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.94 
 
 		 634 aa  101  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.91 
 
 		 647 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.86 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  30.22 
 
 		 637 aa  99.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.46 
 
 		 631 aa  98.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.3 
 
 		 632 aa  98.2  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  25.63 
 
 		 635 aa  98.2  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.86 
 
 		 637 aa  97.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.86 
 
 		 633 aa  96.3  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.74 
 
 		 612 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.18 
 
 		 637 aa  96.3  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  29.86 
 
 		 633 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  30.74 
 
 		 633 aa  96.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  31.2 
 
 		 584 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.4 
 
 		 645 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.4 
 
 		 636 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.37 
 
 		 632 aa  94.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.4 
 
 		 635 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 582 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.4 
 
 		 635 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  29 
 
 		 633 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  29 
 
 		 633 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.04 
 
 		 634 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.79 
 
 		 640 aa  92.8  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.06 
 
 		 631 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.04 
 
 		 631 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.11 
 
 		 638 aa  93.2  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.57 
 
 		 631 aa  93.2  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  29.7 
 
 		 607 aa  93.2  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.25 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.25 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  27.92 
 
 		 619 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  27.92 
 
 		 619 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.82 
 
 		 644 aa  90.9  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  29 
 
 		 622 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  28.25 
 
 		 619 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  28.21 
 
 		 633 aa  90.5  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  27.17 
 
 		 625 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  29.55 
 
 		 631 aa  88.6  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.41 
 
 		 620 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  27.17 
 
 		 626 aa  86.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.23 
 
 		 604 aa  86.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  27.17 
 
 		 624 aa  83.2  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  26.81 
 
 		 622 aa  80.9  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  22.49 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  25.31 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.95 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  28.37 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  30.88 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.3 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  25.86 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  30.88 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  26.79 
 
 		 599 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  27.03 
 
 		 563 aa  55.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 518 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  26.58 
 
 		 575 aa  54.7  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  25.66 
 
 		 577 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  26.42 
 
 		 612 aa  52  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  23.28 
 
 		 584 aa  51.2  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  26.34 
 
 		 573 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  27.59 
 
 		 610 aa  45.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>