101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5309 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  91.28 
 
 		 584 aa  1061    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 582 aa  1174    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  52.72 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  29.06 
 
 		 619 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  29.06 
 
 		 619 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.23 
 
 		 633 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.89 
 
 		 620 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.97 
 
 		 633 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.12 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  31.35 
 
 		 619 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.97 
 
 		 633 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.84 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.23 
 
 		 612 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.84 
 
 		 633 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.84 
 
 		 631 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.71 
 
 		 604 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.83 
 
 		 632 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.48 
 
 		 637 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.2 
 
 		 645 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  31.02 
 
 		 624 aa  103  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  30.55 
 
 		 633 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  31.87 
 
 		 625 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.84 
 
 		 631 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.97 
 
 		 631 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  33.09 
 
 		 607 aa  100  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  31.7 
 
 		 626 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.52 
 
 		 622 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  30 
 
 		 635 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  32.01 
 
 		 633 aa  97.4  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  27.46 
 
 		 633 aa  96.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  31.25 
 
 		 633 aa  96.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  31.25 
 
 		 637 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.21 
 
 		 637 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.1 
 
 		 635 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.26 
 
 		 647 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.1 
 
 		 635 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  29.81 
 
 		 631 aa  94.4  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.02 
 
 		 640 aa  94.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  30.57 
 
 		 788 aa  94  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.73 
 
 		 636 aa  94  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.97 
 
 		 638 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.21 
 
 		 630 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.37 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.84 
 
 		 632 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.6 
 
 		 634 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  30.89 
 
 		 622 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  33.47 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  23.38 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  29.39 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  32.59 
 
 		 573 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31.33 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  34.83 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  31.86 
 
 		 610 aa  67  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  31.72 
 
 		 573 aa  67  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  33.33 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  24.35 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  23.7 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  26.21 
 
 		 757 aa  64.3  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.73 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  24.14 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  26.5 
 
 		 753 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  24.16 
 
 		 773 aa  54.3  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 		 518 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  25.32 
 
 		 743 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  25.43 
 
 		 756 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  26.45 
 
 		 773 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  22.4 
 
 		 634 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 		 788 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 783 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  26.34 
 
 		 783 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  25.76 
 
 		 599 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.41 
 
 		 628 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.41 
 
 		 628 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  25.95 
 
 		 629 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  20.61 
 
 		 627 aa  48.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 773 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  22.14 
 
 		 627 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  22.14 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  22.14 
 
 		 626 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.14 
 
 		 626 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  22.14 
 
 		 626 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 		 785 aa  47.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 831 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  22.14 
 
 		 627 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  27.27 
 
 		 805 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  22.14 
 
 		 627 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  22.14 
 
 		 626 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  26.46 
 
 		 802 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  21.23 
 
 		 627 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  22.14 
 
 		 627 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  24.43 
 
 		 575 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  26.46 
 
 		 786 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  26.15 
 
 		 628 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  23.31 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.06 
 
 		 615 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>