38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5495 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 628 aa  1268    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  28.78 
 
 		 572 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 572 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 696 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 584 aa  158  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.64 
 
 		 598 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  25.68 
 
 		 617 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  25.67 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 662 aa  113  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  30.04 
 
 		 518 aa  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  30.54 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  30.13 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  23.98 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  35.34 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  23.69 
 
 		 601 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  27.51 
 
 		 773 aa  60.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  34.31 
 
 		 689 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 		 689 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  26.41 
 
 		 584 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  33.81 
 
 		 644 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  36.96 
 
 		 805 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  30.29 
 
 		 783 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 783 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  36.96 
 
 		 831 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 		 781 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 		 582 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 759 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  28.57 
 
 		 786 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  25.31 
 
 		 759 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  26.13 
 
 		 757 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  24.39 
 
 		 773 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 802 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  31.06 
 
 		 633 aa  44.3  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  31.06 
 
 		 633 aa  44.3  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  25.33 
 
 		 756 aa  44.3  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>