92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2765 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  97.97 
 
 
689 aa  1200    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  100 
 
 
689 aa  1334    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  43.9 
 
 
677 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  40.92 
 
 
674 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  41.09 
 
 
633 aa  227  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  41.78 
 
 
607 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  44.9 
 
 
644 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  35.61 
 
 
650 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  40.44 
 
 
633 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  40.17 
 
 
633 aa  214  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  49.36 
 
 
637 aa  213  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  39.73 
 
 
705 aa  212  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  37.81 
 
 
636 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  44.21 
 
 
647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  43.39 
 
 
645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  38.53 
 
 
631 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  44.08 
 
 
614 aa  200  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  33.18 
 
 
638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  47.35 
 
 
612 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  47.35 
 
 
612 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  40.69 
 
 
637 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.51 
 
 
618 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  47.06 
 
 
618 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  36.27 
 
 
647 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  35.57 
 
 
777 aa  188  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  38.44 
 
 
624 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.32 
 
 
624 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  41.16 
 
 
624 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  41.2 
 
 
743 aa  180  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  39.46 
 
 
612 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
1006 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.56 
 
 
783 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.56 
 
 
783 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  34.05 
 
 
842 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  35.12 
 
 
852 aa  164  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  34.29 
 
 
769 aa  161  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  33.92 
 
 
781 aa  161  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  38.54 
 
 
793 aa  161  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.36 
 
 
773 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  33.56 
 
 
773 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.37 
 
 
772 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 
772 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 
610 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.84 
 
 
773 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  32.55 
 
 
759 aa  157  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 
759 aa  157  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  36.24 
 
 
781 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  33.79 
 
 
802 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  35.84 
 
 
766 aa  154  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  35.37 
 
 
778 aa  153  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
756 aa  153  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  31.86 
 
 
785 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 
757 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  32.7 
 
 
786 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  35.81 
 
 
913 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  37.84 
 
 
831 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  37.84 
 
 
805 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  32.2 
 
 
785 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  35.91 
 
 
788 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.62 
 
 
773 aa  143  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  34.67 
 
 
570 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 
570 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  34.85 
 
 
570 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  34.53 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  33.76 
 
 
576 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  34.27 
 
 
749 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  36.24 
 
 
578 aa  127  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  37.11 
 
 
571 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  37.11 
 
 
571 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  37.11 
 
 
571 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  37.05 
 
 
564 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  30.3 
 
 
510 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 
605 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.53 
 
 
562 aa  98.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  30.23 
 
 
510 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29 
 
 
510 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29 
 
 
510 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29 
 
 
510 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  30.74 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  39.25 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  37.84 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  32.16 
 
 
519 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 
634 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  26.35 
 
 
628 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
638 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  26.35 
 
 
628 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.85 
 
 
678 aa  48.5  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.58 
 
 
598 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  24.71 
 
 
629 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  25.68 
 
 
584 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  28.83 
 
 
563 aa  45.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>