88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2163 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  99.88 
 
 		 805 aa  1602    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  48.69 
 
 		 852 aa  719    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 831 aa  1651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  48.56 
 
 		 842 aa  763    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  37.91 
 
 		 783 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  37.91 
 
 		 783 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  38.78 
 
 		 788 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  42.27 
 
 		 781 aa  204  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 		 773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  41.52 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  34.25 
 
 		 757 aa  200  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  36.33 
 
 		 785 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  36.9 
 
 		 785 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  42.27 
 
 		 637 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  39.45 
 
 		 773 aa  191  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  37.02 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  37.02 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  39.52 
 
 		 778 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  40.89 
 
 		 614 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  36.15 
 
 		 773 aa  187  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  37.41 
 
 		 773 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  39.73 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  25.78 
 
 		 1006 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 756 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  35.35 
 
 		 786 aa  179  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 		 777 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  34.43 
 
 		 607 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  34.68 
 
 		 802 aa  173  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  37.09 
 
 		 781 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.11 
 
 		 618 aa  172  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  32.04 
 
 		 705 aa  171  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  39.12 
 
 		 610 aa  169  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  35.25 
 
 		 759 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  35.25 
 
 		 759 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  37.54 
 
 		 766 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  38.13 
 
 		 677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  37.29 
 
 		 612 aa  161  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  38.01 
 
 		 749 aa  160  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  33.04 
 
 		 769 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  33.63 
 
 		 647 aa  158  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  35.31 
 
 		 913 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  37.01 
 
 		 612 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  41.07 
 
 		 612 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  36.82 
 
 		 689 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  40.76 
 
 		 689 aa  148  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  31.04 
 
 		 633 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 		 636 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  32.99 
 
 		 633 aa  145  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  32.65 
 
 		 633 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.24 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  34.77 
 
 		 644 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  30.63 
 
 		 637 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 		 650 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  33.9 
 
 		 638 aa  135  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  30.93 
 
 		 647 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  36.46 
 
 		 674 aa  134  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  33.79 
 
 		 645 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  38.96 
 
 		 618 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  33.82 
 
 		 570 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 		 624 aa  129  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  36.86 
 
 		 576 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  32.59 
 
 		 570 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  32.59 
 
 		 570 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  32.59 
 
 		 570 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34.12 
 
 		 578 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  33.68 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  32.65 
 
 		 624 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  32.65 
 
 		 624 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 		 605 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  35.19 
 
 		 571 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 		 571 aa  111  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 		 571 aa  111  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.11 
 
 		 562 aa  97.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  26.91 
 
 		 510 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  25.99 
 
 		 510 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  25.99 
 
 		 510 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  25.99 
 
 		 510 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  33.49 
 
 		 552 aa  89.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  27.99 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 638 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  27.65 
 
 		 584 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.46 
 
 		 678 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  26.21 
 
 		 599 aa  48.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 582 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  27.54 
 
 		 612 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  34.31 
 
 		 628 aa  45.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>