101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2621 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  56.15 
 
 		 778 aa  851    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  100 
 
 		 785 aa  1625    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  56.41 
 
 		 786 aa  934    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  45.33 
 
 		 777 aa  701    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  47.91 
 
 		 773 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  54.9 
 
 		 802 aa  886    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  87.52 
 
 		 785 aa  1452    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  46.59 
 
 		 793 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  55.81 
 
 		 781 aa  849    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  53.35 
 
 		 743 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  58.86 
 
 		 783 aa  942    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  59.67 
 
 		 772 aa  970    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  58.86 
 
 		 783 aa  942    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  59.67 
 
 		 772 aa  970    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  56.8 
 
 		 773 aa  855    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  48.65 
 
 		 781 aa  743    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  50.44 
 
 		 788 aa  768    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  55.73 
 
 		 773 aa  804    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  32.51 
 
 		 757 aa  425  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  34.84 
 
 		 773 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  34.18 
 
 		 756 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 		 766 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  35.38 
 
 		 749 aa  402  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  33 
 
 		 759 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  33 
 
 		 759 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  31.55 
 
 		 769 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  32.15 
 
 		 610 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  34.62 
 
 		 517 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  32.09 
 
 		 605 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.7 
 
 		 578 aa  224  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.13 
 
 		 562 aa  218  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  35.47 
 
 		 852 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  36.9 
 
 		 831 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  36.9 
 
 		 805 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  36.05 
 
 		 842 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  30.67 
 
 		 519 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  34.11 
 
 		 637 aa  178  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 		 1006 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 		 913 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  32.31 
 
 		 633 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  35.74 
 
 		 614 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  30.84 
 
 		 612 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 		 689 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  29.35 
 
 		 705 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.55 
 
 		 618 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 		 677 aa  151  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 		 689 aa  151  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  27.76 
 
 		 633 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  34.73 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  27.48 
 
 		 633 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  32.99 
 
 		 638 aa  145  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 636 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  32.31 
 
 		 644 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  29.82 
 
 		 650 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  31.1 
 
 		 624 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  30.48 
 
 		 612 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 		 647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  30.82 
 
 		 612 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  30.38 
 
 		 645 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  31.67 
 
 		 624 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  30.1 
 
 		 647 aa  130  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  31.44 
 
 		 637 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  32.01 
 
 		 576 aa  125  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  28.62 
 
 		 674 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 		 570 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  34.14 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  29.97 
 
 		 564 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  33.49 
 
 		 570 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 571 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 510 aa  94  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  31.14 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  31.14 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  31.14 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 571 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 571 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  32.89 
 
 		 510 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  29.35 
 
 		 552 aa  77  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  26.53 
 
 		 612 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  30.3 
 
 		 601 aa  52.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 634 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.67 
 
 		 678 aa  52  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 		 520 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  24.18 
 
 		 627 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 		 627 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  23.89 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  23.89 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.89 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  23.89 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  23.89 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 		 572 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  23.89 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  23.89 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  23.89 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  23.72 
 
 		 638 aa  44.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  23.25 
 
 		 575 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>