83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0602 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  100 
 
 
532 aa  976    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  43.6 
 
 
769 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 
783 aa  272  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  33.51 
 
 
783 aa  272  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  32.53 
 
 
785 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  32.07 
 
 
785 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  33.57 
 
 
772 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  33.57 
 
 
772 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  32.87 
 
 
786 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.75 
 
 
773 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.1 
 
 
773 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  34.26 
 
 
781 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  31.95 
 
 
802 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  32.88 
 
 
778 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 
777 aa  209  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 
788 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  36.67 
 
 
743 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  32.86 
 
 
773 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.49 
 
 
562 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  34.32 
 
 
793 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  32.15 
 
 
773 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  30.99 
 
 
759 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 
759 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  38.16 
 
 
605 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  29.78 
 
 
756 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  32.5 
 
 
766 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  32.64 
 
 
610 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 
781 aa  181  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 
757 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  35.34 
 
 
749 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  35.11 
 
 
517 aa  173  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 
578 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  35.56 
 
 
519 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  33.57 
 
 
852 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  38.35 
 
 
576 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 
607 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
842 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  38.7 
 
 
689 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  37.84 
 
 
689 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  34.63 
 
 
564 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  35.09 
 
 
633 aa  107  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  34.04 
 
 
570 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  34.04 
 
 
570 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  35.09 
 
 
633 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  34.39 
 
 
633 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  33.74 
 
 
570 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  30.03 
 
 
705 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 
1006 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  31.18 
 
 
637 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  32.75 
 
 
631 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
913 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  33.44 
 
 
618 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  31.47 
 
 
614 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  37.91 
 
 
570 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 
571 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  37.66 
 
 
624 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  33.33 
 
 
674 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  36.71 
 
 
624 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  36.71 
 
 
624 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
677 aa  98.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  31.8 
 
 
644 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  32.89 
 
 
650 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  34.52 
 
 
638 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  34.49 
 
 
571 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  34.49 
 
 
571 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  30.96 
 
 
637 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
647 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  30.66 
 
 
645 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.93 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.93 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.93 
 
 
510 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  29.86 
 
 
612 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  33.33 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  32.22 
 
 
612 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.66 
 
 
618 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
636 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 
647 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  30.09 
 
 
510 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  30.11 
 
 
552 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1065  von Willebrand factor, type A  28.24 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3051  hitchhiker  0.00169638 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
520 aa  45.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
219 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>