94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0973 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  85.1 
 
 
624 aa  1013    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  83.97 
 
 
624 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
624 aa  1242    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  50.08 
 
 
638 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  44.1 
 
 
650 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  47.15 
 
 
644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  40.9 
 
 
647 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  40.78 
 
 
636 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  38.71 
 
 
633 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  39.34 
 
 
633 aa  382  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  39.34 
 
 
633 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  39.21 
 
 
631 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  37.42 
 
 
645 aa  355  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  39.5 
 
 
637 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  34.66 
 
 
607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  40.78 
 
 
614 aa  289  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  36.04 
 
 
612 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  34.84 
 
 
637 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  35.28 
 
 
612 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 
612 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.07 
 
 
618 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  31.16 
 
 
647 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  34.97 
 
 
618 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  39.12 
 
 
689 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  38.44 
 
 
689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  36.18 
 
 
705 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  30.88 
 
 
552 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  35.81 
 
 
759 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  35.81 
 
 
759 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 
756 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 
777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  39.92 
 
 
677 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  38.91 
 
 
781 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  34 
 
 
786 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  35.29 
 
 
674 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  35.12 
 
 
773 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 
802 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
773 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.8 
 
 
773 aa  150  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  35.95 
 
 
781 aa  150  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  30.6 
 
 
783 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
757 aa  147  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 
783 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  35.25 
 
 
913 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  33.88 
 
 
772 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  35.12 
 
 
743 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  33.88 
 
 
772 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  33.66 
 
 
778 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
793 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  37.2 
 
 
749 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  36.24 
 
 
769 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 
773 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  31.37 
 
 
785 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  31.1 
 
 
785 aa  140  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  31.77 
 
 
852 aa  137  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 
1006 aa  137  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  34.46 
 
 
788 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.13 
 
 
766 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  31.63 
 
 
805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
831 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  33.56 
 
 
564 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 
842 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 
578 aa  124  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
570 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
570 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
570 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  33.66 
 
 
605 aa  122  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 
610 aa  120  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.89 
 
 
517 aa  120  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  35.42 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  35.69 
 
 
576 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  34.14 
 
 
571 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  34.14 
 
 
571 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  34.02 
 
 
571 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  35.36 
 
 
570 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.62 
 
 
510 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.62 
 
 
510 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.62 
 
 
510 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  32.51 
 
 
510 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.65 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  36.55 
 
 
532 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1423  von Willebrand factor, type A  26.63 
 
 
599 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  29.1 
 
 
519 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  28.3 
 
 
627 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  28.3 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  28.3 
 
 
627 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  28.3 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  28.3 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.3 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  28.3 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  28.3 
 
 
627 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
627 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 
627 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  28.3 
 
 
627 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>