90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0430 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  48.72 
 
 		 778 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  50.45 
 
 		 781 aa  777    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  46.06 
 
 		 772 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  46.06 
 
 		 772 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  42.84 
 
 		 793 aa  670    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  46.4 
 
 		 785 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  42.52 
 
 		 802 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  47.69 
 
 		 773 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 777 aa  1606    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  42.7 
 
 		 786 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  45.33 
 
 		 785 aa  701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  42.88 
 
 		 773 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  42.78 
 
 		 783 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  42.78 
 
 		 783 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  42.08 
 
 		 743 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  43.13 
 
 		 773 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  39.29 
 
 		 781 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  39.82 
 
 		 788 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 756 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  32.24 
 
 		 757 aa  422  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  32.31 
 
 		 759 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  32.31 
 
 		 759 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  30.82 
 
 		 773 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  31.66 
 
 		 766 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 749 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 610 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  26.47 
 
 		 769 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31.75 
 
 		 605 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 		 852 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 		 517 aa  194  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  35.59 
 
 		 689 aa  190  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  35.59 
 
 		 689 aa  187  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  34.55 
 
 		 614 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  40.95 
 
 		 578 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 		 842 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  34.11 
 
 		 637 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 913 aa  177  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 		 1006 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 		 633 aa  173  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 		 831 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  30.59 
 
 		 805 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  32.43 
 
 		 705 aa  171  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  32.88 
 
 		 633 aa  171  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  32.53 
 
 		 633 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 		 631 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  31.19 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 		 624 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  34.69 
 
 		 674 aa  161  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.67 
 
 		 618 aa  158  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  31.86 
 
 		 636 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 		 638 aa  154  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  34.33 
 
 		 637 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  34.06 
 
 		 647 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  36.4 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  31.27 
 
 		 644 aa  152  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  30.23 
 
 		 612 aa  152  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  32.13 
 
 		 624 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  32.13 
 
 		 624 aa  151  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  32.18 
 
 		 612 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  32.18 
 
 		 612 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 		 647 aa  145  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.06 
 
 		 562 aa  145  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 532 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 		 650 aa  145  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  30.04 
 
 		 677 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  32.31 
 
 		 645 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  28.23 
 
 		 519 aa  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  29.31 
 
 		 576 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  28.62 
 
 		 570 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  27.76 
 
 		 564 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 570 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 570 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  30.2 
 
 		 571 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  33.33 
 
 		 510 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.17 
 
 		 510 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.17 
 
 		 510 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.17 
 
 		 510 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  26.96 
 
 		 510 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  29.55 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 		 678 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 572 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 572 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  23.81 
 
 		 612 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  29.44 
 
 		 490 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  23.38 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  23.38 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  34.65 
 
 		 634 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>