101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4345 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  54.1 
 
 		 778 aa  809    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  54.9 
 
 		 785 aa  907    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  92.24 
 
 		 786 aa  1498    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  42.68 
 
 		 777 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  46.66 
 
 		 773 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 802 aa  1642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  54.08 
 
 		 785 aa  894    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  47.83 
 
 		 793 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  51.51 
 
 		 781 aa  770    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  50.79 
 
 		 743 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  55.56 
 
 		 783 aa  852    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  54.82 
 
 		 772 aa  848    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  55.56 
 
 		 783 aa  852    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  54.82 
 
 		 772 aa  848    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  53.17 
 
 		 773 aa  788    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  49.31 
 
 		 781 aa  728    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  48.36 
 
 		 788 aa  702    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  52.66 
 
 		 773 aa  757    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  34.69 
 
 		 773 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  34.34 
 
 		 757 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  36.23 
 
 		 766 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 		 759 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  35.75 
 
 		 759 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 756 aa  425  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  35.03 
 
 		 749 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  28.28 
 
 		 769 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  34.76 
 
 		 610 aa  278  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 		 605 aa  210  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  31.44 
 
 		 517 aa  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.37 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.01 
 
 		 562 aa  190  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  34.22 
 
 		 852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  32.51 
 
 		 842 aa  173  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  34.68 
 
 		 831 aa  173  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  34.68 
 
 		 805 aa  173  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  34.13 
 
 		 637 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 		 532 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 		 913 aa  163  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  31.99 
 
 		 607 aa  162  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 		 633 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  32.42 
 
 		 705 aa  160  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  33.44 
 
 		 631 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 1006 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  33.57 
 
 		 689 aa  157  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  34.11 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  34.11 
 
 		 638 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  33.33 
 
 		 644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 		 689 aa  155  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 		 624 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 650 aa  153  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  29.48 
 
 		 633 aa  151  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  29.18 
 
 		 633 aa  149  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  32 
 
 		 612 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  32.03 
 
 		 677 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 647 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 636 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  30.17 
 
 		 519 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.05 
 
 		 618 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  33.78 
 
 		 624 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  33.78 
 
 		 624 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  31 
 
 		 645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  33.33 
 
 		 637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  31.14 
 
 		 612 aa  137  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 		 618 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  31.14 
 
 		 612 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  32.87 
 
 		 576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  30.56 
 
 		 674 aa  130  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 		 647 aa  128  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 		 570 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 		 570 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 		 564 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  28.68 
 
 		 570 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 510 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 		 571 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.82 
 
 		 510 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 		 571 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.82 
 
 		 510 aa  88.2  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.82 
 
 		 510 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  27.78 
 
 		 510 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  29.37 
 
 		 571 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  30.21 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 		 634 aa  51.2  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  25.67 
 
 		 584 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 582 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.79 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.38 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  25.79 
 
 		 627 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.38 
 
 		 636 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.88 
 
 		 635 aa  44.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.88 
 
 		 635 aa  44.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  23.96 
 
 		 638 aa  44.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>