102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2324 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
618 aa  1278    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  49.43 
 
 
612 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  48.94 
 
 
612 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  46.39 
 
 
612 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  44.37 
 
 
607 aa  528  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  44.82 
 
 
614 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  41.17 
 
 
647 aa  498  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  43.23 
 
 
637 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  40.16 
 
 
618 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  32.61 
 
 
633 aa  330  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  32.5 
 
 
633 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  32.19 
 
 
633 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  32.92 
 
 
631 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 
647 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  34 
 
 
552 aa  300  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 
636 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  31.19 
 
 
650 aa  286  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  31.54 
 
 
644 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  31.23 
 
 
624 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  30.89 
 
 
645 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  31.34 
 
 
624 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  30.96 
 
 
624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  31.01 
 
 
637 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  30.47 
 
 
638 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  36.61 
 
 
677 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  31.23 
 
 
689 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 
689 aa  194  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.9 
 
 
705 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  34.33 
 
 
852 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
781 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 
842 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  34.24 
 
 
756 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  32.11 
 
 
831 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  32.11 
 
 
805 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  33.22 
 
 
674 aa  171  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  33.56 
 
 
773 aa  170  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 
1006 aa  170  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 
759 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  34.56 
 
 
759 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  30.54 
 
 
773 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  33.44 
 
 
773 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  37 
 
 
743 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 
757 aa  158  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.67 
 
 
777 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 
783 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  30.54 
 
 
783 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  30.55 
 
 
785 aa  151  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 
772 aa  150  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  30.65 
 
 
772 aa  150  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  34.66 
 
 
769 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  29.64 
 
 
785 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  28.16 
 
 
786 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  28.05 
 
 
802 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  32.62 
 
 
766 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 
749 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  31.51 
 
 
793 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  31.23 
 
 
773 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 
788 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 
781 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  35.65 
 
 
913 aa  130  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  29.77 
 
 
778 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  30.42 
 
 
564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 
578 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  30.74 
 
 
576 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
570 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
570 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  31.6 
 
 
570 aa  107  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  28.04 
 
 
517 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 
571 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 
571 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  28.67 
 
 
571 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
605 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  25.6 
 
 
510 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  25.6 
 
 
510 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  25.6 
 
 
510 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  25.76 
 
 
510 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  23.02 
 
 
510 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.51 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
532 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  22.9 
 
 
519 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  27.95 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  27.95 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  24.74 
 
 
612 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  23.27 
 
 
629 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  27.95 
 
 
627 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  27.95 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.95 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  27.95 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  27.95 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  27.95 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
627 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0602  hypothetical protein  31.45 
 
 
558 aa  47.4  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0984016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  27.42 
 
 
599 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  29.11 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  29.11 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  27.95 
 
 
627 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.1 
 
 
678 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>