85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1816 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  49.67 
 
 		 757 aa  784    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 759 aa  1552    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  59.48 
 
 		 766 aa  876    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  58.34 
 
 		 749 aa  842    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 759 aa  1552    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  69.37 
 
 		 756 aa  1075    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  70.72 
 
 		 773 aa  1099    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  36.13 
 
 		 786 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  37.52 
 
 		 778 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  36.77 
 
 		 781 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  35.32 
 
 		 793 aa  425  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  32.31 
 
 		 777 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  35.09 
 
 		 773 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  34.07 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  35.17 
 
 		 802 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  33.21 
 
 		 785 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  33.41 
 
 		 785 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.12 
 
 		 783 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.12 
 
 		 783 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.42 
 
 		 773 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  34.63 
 
 		 743 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  35.65 
 
 		 773 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  35.18 
 
 		 788 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  33.83 
 
 		 781 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  30.52 
 
 		 769 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  33.78 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 		 578 aa  193  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  37.54 
 
 		 852 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  39.38 
 
 		 636 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  38.1 
 
 		 633 aa  190  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  36.91 
 
 		 633 aa  190  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  37.76 
 
 		 633 aa  188  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  36.54 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  35.22 
 
 		 607 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  37.17 
 
 		 842 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  37.5 
 
 		 637 aa  181  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  36.95 
 
 		 614 aa  180  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 605 aa  177  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.07 
 
 		 517 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  35.81 
 
 		 624 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  35.25 
 
 		 805 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  35.25 
 
 		 831 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.56 
 
 		 618 aa  168  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  33.75 
 
 		 913 aa  164  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  34.93 
 
 		 644 aa  163  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  32.89 
 
 		 689 aa  160  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  35.87 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.45 
 
 		 705 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  33.55 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  33.9 
 
 		 650 aa  157  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 		 689 aa  157  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  32.99 
 
 		 647 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  34.46 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  34.7 
 
 		 612 aa  153  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  36.49 
 
 		 624 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  36.15 
 
 		 624 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  35.64 
 
 		 612 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 1006 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  35.29 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  32.32 
 
 		 638 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 677 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 647 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  35.98 
 
 		 618 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  31.86 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  32.45 
 
 		 576 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.88 
 
 		 562 aa  125  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 		 532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  29.83 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  27.62 
 
 		 519 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 		 564 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 		 510 aa  105  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.03 
 
 		 510 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.03 
 
 		 510 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.03 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 		 571 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 		 571 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 		 571 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.11 
 
 		 510 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  28.5 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  23.02 
 
 		 634 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  28.35 
 
 		 617 aa  44.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>