84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2537 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  98.77 
 
 
571 aa  1116    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  70.97 
 
 
564 aa  735    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
571 aa  1127    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
571 aa  1127    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  38.48 
 
 
570 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  36.75 
 
 
570 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 
570 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 
570 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  37.22 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  37.11 
 
 
689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  37.11 
 
 
689 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  34.8 
 
 
614 aa  147  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  33.55 
 
 
644 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
783 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  33.33 
 
 
783 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 
650 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  33.9 
 
 
636 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  30.28 
 
 
607 aa  136  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  36.27 
 
 
769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  32.53 
 
 
633 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  34.28 
 
 
743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  34.14 
 
 
624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
647 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 
637 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 
773 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  33.11 
 
 
633 aa  130  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  34.84 
 
 
831 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  33.11 
 
 
633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  34.84 
 
 
805 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 
777 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  32.67 
 
 
773 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  31.34 
 
 
785 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  32.66 
 
 
677 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  31.72 
 
 
772 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  34.6 
 
 
624 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  34.6 
 
 
624 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  34.83 
 
 
638 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  31.72 
 
 
772 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 
1006 aa  123  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.01 
 
 
618 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  33.88 
 
 
793 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  31.95 
 
 
647 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.4 
 
 
773 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  33.98 
 
 
612 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  33.33 
 
 
778 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  35.12 
 
 
781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  34.26 
 
 
612 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  32.21 
 
 
913 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  29.76 
 
 
785 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 
781 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  30.8 
 
 
631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  30.25 
 
 
645 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  32.89 
 
 
674 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 
759 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  31.71 
 
 
759 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  31.4 
 
 
637 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  29.31 
 
 
802 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  27.76 
 
 
773 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  31.54 
 
 
517 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
610 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  32.31 
 
 
618 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 
788 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 
612 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  29.04 
 
 
786 aa  104  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
852 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 
766 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 
756 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.61 
 
 
510 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.61 
 
 
510 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.61 
 
 
510 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  31.29 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 
842 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  25.17 
 
 
757 aa  98.2  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
510 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  30 
 
 
578 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  32.85 
 
 
749 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.21 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31 
 
 
605 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.13 
 
 
562 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  30.94 
 
 
519 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  32.04 
 
 
552 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  33.6 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  38.82 
 
 
634 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  36.81 
 
 
583 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>