91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3054 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  56.11 
 
 		 778 aa  829    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  58.9 
 
 		 781 aa  869    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 772 aa  1565    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  59.49 
 
 		 783 aa  934    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 772 aa  1565    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  47.82 
 
 		 793 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  58.63 
 
 		 773 aa  863    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  59.49 
 
 		 783 aa  934    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  51.92 
 
 		 781 aa  747    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  59.21 
 
 		 785 aa  979    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  54.82 
 
 		 802 aa  844    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  50.13 
 
 		 773 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  51.46 
 
 		 788 aa  762    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  46.06 
 
 		 777 aa  707    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  54.57 
 
 		 786 aa  866    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  59.67 
 
 		 785 aa  988    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  56.99 
 
 		 773 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  53.41 
 
 		 743 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 		 756 aa  446  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.16 
 
 		 757 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  35.22 
 
 		 773 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  36.34 
 
 		 749 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  34.07 
 
 		 759 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 		 759 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  35.19 
 
 		 766 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  33.03 
 
 		 769 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.31 
 
 		 610 aa  277  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  35.61 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.9 
 
 		 562 aa  210  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  37.84 
 
 		 852 aa  207  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  38.1 
 
 		 842 aa  194  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  34.6 
 
 		 532 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  37.02 
 
 		 831 aa  190  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  37.02 
 
 		 805 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  37 
 
 		 637 aa  184  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  31.99 
 
 		 913 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  33.48 
 
 		 519 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 		 607 aa  170  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 1006 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  34.78 
 
 		 614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  35.74 
 
 		 689 aa  162  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  34.35 
 
 		 633 aa  161  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 636 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  35.4 
 
 		 689 aa  158  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  35.6 
 
 		 612 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  34.92 
 
 		 705 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  32.38 
 
 		 677 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  35.79 
 
 		 644 aa  151  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  34.11 
 
 		 633 aa  151  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.65 
 
 		 618 aa  151  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  32.39 
 
 		 650 aa  151  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  33.78 
 
 		 633 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  34.25 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  36.43 
 
 		 638 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  33.88 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  33.9 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  35.68 
 
 		 618 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  29.59 
 
 		 647 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  32.21 
 
 		 645 aa  138  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  31.97 
 
 		 637 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  33.88 
 
 		 624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  33.55 
 
 		 624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  35.31 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  28.83 
 
 		 647 aa  130  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  31.45 
 
 		 674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 		 570 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  28.91 
 
 		 570 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  28.91 
 
 		 570 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 570 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  32.07 
 
 		 571 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  31.72 
 
 		 571 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  31.72 
 
 		 571 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  31.34 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  31.34 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  31.34 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 		 510 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  33.04 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  30.37 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2512  hypothetical protein  93.55 
 
 		 39 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.456198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2142  hypothetical protein  93.55 
 
 		 39 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  23.81 
 
 		 612 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.39 
 
 		 678 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  23.9 
 
 		 599 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 634 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.29 
 
 		 598 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  30.5 
 
 		 601 aa  44.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 572 aa  44.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>