98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0555 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  100 
 
 
614 aa  1235    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  55.12 
 
 
612 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  52.27 
 
 
637 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.34 
 
 
618 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  48.04 
 
 
607 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  47.93 
 
 
612 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  40.22 
 
 
647 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  47.93 
 
 
612 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  45.23 
 
 
618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  39.75 
 
 
633 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  39.75 
 
 
633 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  38.75 
 
 
633 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  38.35 
 
 
631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  37.3 
 
 
636 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  38.43 
 
 
624 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  37.46 
 
 
647 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  40.93 
 
 
552 aa  346  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  37.83 
 
 
645 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  39.38 
 
 
644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  37.48 
 
 
650 aa  321  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  38.92 
 
 
624 aa  320  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  38.03 
 
 
624 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  36.56 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  36.02 
 
 
638 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  38.91 
 
 
705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  41.02 
 
 
689 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  44.08 
 
 
689 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  36.94 
 
 
842 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  37.79 
 
 
852 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  39.93 
 
 
677 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  37.72 
 
 
805 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  37.72 
 
 
831 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  37.04 
 
 
756 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  34.55 
 
 
777 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  35.67 
 
 
674 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  35.69 
 
 
773 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  36.95 
 
 
759 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  36.95 
 
 
759 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  37.64 
 
 
781 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 
1006 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  36.43 
 
 
773 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.27 
 
 
773 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.93 
 
 
783 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.93 
 
 
783 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  31.98 
 
 
786 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  34.78 
 
 
772 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 
772 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  39.73 
 
 
781 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  32.67 
 
 
743 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 
757 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  34.11 
 
 
802 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  35.74 
 
 
793 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  35.74 
 
 
785 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  33.43 
 
 
773 aa  153  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  32.33 
 
 
785 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.93 
 
 
766 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  35.33 
 
 
778 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  34.01 
 
 
788 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  39.06 
 
 
913 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  36.39 
 
 
749 aa  146  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  36.05 
 
 
769 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.81 
 
 
610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 
578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  35.25 
 
 
564 aa  137  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
570 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  34.8 
 
 
571 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  34.8 
 
 
571 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  34.8 
 
 
571 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  34.77 
 
 
576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
605 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  32.96 
 
 
570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  30.42 
 
 
510 aa  107  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.27 
 
 
510 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  31.29 
 
 
510 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.27 
 
 
510 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.27 
 
 
510 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.05 
 
 
562 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  27.8 
 
 
519 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  31.02 
 
 
532 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  28.12 
 
 
629 aa  47.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.64 
 
 
628 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.92 
 
 
626 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  28.92 
 
 
627 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  28.92 
 
 
627 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  28.92 
 
 
626 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  28.92 
 
 
627 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.64 
 
 
628 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  28.92 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  28.92 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  28.92 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 
627 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
634 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 
627 aa  45.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 
638 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0602  hypothetical protein  32.63 
 
 
558 aa  43.9  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0984016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>