83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0825 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  100 
 
 		 674 aa  1321    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  40.62 
 
 		 677 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  40.92 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  40.14 
 
 		 689 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  37.53 
 
 		 633 aa  230  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  37.28 
 
 		 633 aa  228  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  36.39 
 
 		 633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  37.39 
 
 		 636 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  36.53 
 
 		 631 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 		 647 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  39.25 
 
 		 637 aa  196  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  37.72 
 
 		 705 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  37.07 
 
 		 607 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  33.49 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  41.34 
 
 		 638 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  37.94 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  39.7 
 
 		 645 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  35.61 
 
 		 612 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  40.49 
 
 		 612 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  36.16 
 
 		 756 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.22 
 
 		 618 aa  181  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  33.51 
 
 		 612 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  34.69 
 
 		 777 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  33.81 
 
 		 647 aa  173  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  37.59 
 
 		 644 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  35.87 
 
 		 759 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  35.87 
 
 		 759 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  33.43 
 
 		 650 aa  170  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  35.29 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  37.02 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  37.02 
 
 		 624 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  33 
 
 		 1006 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  34.3 
 
 		 773 aa  160  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  30.41 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  34.44 
 
 		 769 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  34.4 
 
 		 852 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  36.95 
 
 		 618 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  36.14 
 
 		 913 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  34.88 
 
 		 743 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.82 
 
 		 766 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 		 757 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  35.54 
 
 		 793 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.09 
 
 		 610 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  36.46 
 
 		 831 aa  146  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  36.46 
 
 		 805 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 		 781 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  34.95 
 
 		 773 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  36.73 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 802 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 773 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  34.01 
 
 		 781 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  33.69 
 
 		 842 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  29.9 
 
 		 786 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  31.45 
 
 		 772 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 		 772 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  36.16 
 
 		 570 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  28.62 
 
 		 785 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  28.62 
 
 		 785 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  33.57 
 
 		 778 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  35.62 
 
 		 578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  36.94 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 		 773 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  34.1 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  32.64 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  33.99 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 		 571 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 		 571 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  30.97 
 
 		 517 aa  94.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.72 
 
 		 562 aa  91.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  26.8 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  26.47 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  26.47 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  26.47 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  25.97 
 
 		 510 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  35.98 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  26.32 
 
 		 552 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  30.07 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  27.5 
 
 		 629 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>