108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1043 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  53.07 
 
 
773 aa  726    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  65.56 
 
 
778 aa  1010    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  55.81 
 
 
785 aa  887    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  51.89 
 
 
786 aa  819    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  50.45 
 
 
777 aa  810    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  51.28 
 
 
773 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  51.39 
 
 
802 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  55.49 
 
 
785 aa  873    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  53.77 
 
 
793 aa  794    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
781 aa  1585    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  52.99 
 
 
743 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  53.15 
 
 
783 aa  813    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  58.9 
 
 
772 aa  888    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  53.15 
 
 
783 aa  813    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  58.9 
 
 
772 aa  888    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  55.3 
 
 
773 aa  799    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  48.2 
 
 
788 aa  672    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  50.57 
 
 
781 aa  710    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  36.22 
 
 
773 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  36.09 
 
 
756 aa  475  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  36.83 
 
 
759 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  36.83 
 
 
759 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.5 
 
 
757 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  36.76 
 
 
766 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  36.89 
 
 
749 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  32.84 
 
 
769 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.85 
 
 
610 aa  259  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  37.65 
 
 
605 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  34.76 
 
 
517 aa  226  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
578 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  41.3 
 
 
637 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  36.74 
 
 
842 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.28 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  36.3 
 
 
852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  37.09 
 
 
831 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  37.09 
 
 
805 aa  190  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  34.9 
 
 
913 aa  184  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  35.52 
 
 
532 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  39.73 
 
 
614 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  36.36 
 
 
689 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  36.01 
 
 
689 aa  177  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  36.91 
 
 
633 aa  175  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
1006 aa  174  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  34.69 
 
 
633 aa  173  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  36.58 
 
 
633 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 
607 aa  172  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  36.12 
 
 
644 aa  170  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  36.51 
 
 
612 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.75 
 
 
631 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  36.64 
 
 
638 aa  168  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  36.88 
 
 
618 aa  168  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  35.95 
 
 
624 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
636 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.11 
 
 
705 aa  165  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  33.14 
 
 
519 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  37.02 
 
 
612 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
677 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.39 
 
 
618 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  36.68 
 
 
612 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  32.32 
 
 
647 aa  154  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  33.9 
 
 
637 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  31.96 
 
 
650 aa  153  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.22 
 
 
624 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  35.22 
 
 
624 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  34.11 
 
 
674 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  33.11 
 
 
645 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 
647 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  37.33 
 
 
576 aa  138  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  32.69 
 
 
564 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  34.23 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  32.41 
 
 
570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  32.41 
 
 
570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  32.07 
 
 
570 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  35.45 
 
 
571 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  35.12 
 
 
571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  35.12 
 
 
571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.74 
 
 
510 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.74 
 
 
510 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.74 
 
 
510 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  29.1 
 
 
510 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.12 
 
 
510 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  34.66 
 
 
552 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.22 
 
 
678 aa  54.3  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  26.13 
 
 
584 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  26.55 
 
 
601 aa  52  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
582 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1423  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 
599 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  26.71 
 
 
612 aa  48.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.25 
 
 
628 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.25 
 
 
628 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  24.55 
 
 
627 aa  48.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  26.01 
 
 
627 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  26.01 
 
 
626 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.01 
 
 
626 aa  48.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  26.01 
 
 
626 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  26.01 
 
 
626 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  32.5 
 
 
572 aa  48.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  26.01 
 
 
626 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  26.01 
 
 
627 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  26.01 
 
 
627 aa  47.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>