73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0117 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  100 
 
 
552 aa  1126    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  37.01 
 
 
607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  40.12 
 
 
614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.6 
 
 
618 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  38.08 
 
 
612 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  39.26 
 
 
612 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  36.86 
 
 
637 aa  279  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  37.87 
 
 
618 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  39.47 
 
 
612 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 
647 aa  260  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  34.29 
 
 
633 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  33.91 
 
 
633 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
636 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 
633 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 
631 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 
647 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  30.88 
 
 
624 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 
650 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  31.36 
 
 
624 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  30.51 
 
 
644 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  29.56 
 
 
637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  31.19 
 
 
645 aa  163  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  30.97 
 
 
624 aa  161  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  31.08 
 
 
638 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  31.46 
 
 
773 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  33.49 
 
 
805 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  33.49 
 
 
831 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 
783 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  32.76 
 
 
783 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 
842 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 
773 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  32.24 
 
 
743 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 
852 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  29.35 
 
 
785 aa  77  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
677 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 
777 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  37.84 
 
 
689 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  24.78 
 
 
1006 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  37.84 
 
 
689 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  30.37 
 
 
772 aa  74.3  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
772 aa  74.3  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 
913 aa  73.9  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  40.18 
 
 
769 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  32.11 
 
 
781 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  34.66 
 
 
781 aa  69.7  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 
785 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  30.21 
 
 
802 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  29.83 
 
 
786 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  28.5 
 
 
759 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
759 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
756 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  26.32 
 
 
674 aa  64.7  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  32.58 
 
 
564 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
788 aa  63.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  24.77 
 
 
705 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  33.53 
 
 
793 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  27.01 
 
 
773 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 
757 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  28.26 
 
 
766 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  31.15 
 
 
778 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  32.75 
 
 
749 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 
773 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  27.38 
 
 
510 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  27.38 
 
 
510 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  27.38 
 
 
510 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  30.53 
 
 
576 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 
510 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 
570 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 
610 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 
570 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 
578 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  30 
 
 
570 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>