93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1677 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  53.3 
 
 		 778 aa  798    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  52.38 
 
 		 743 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  52.96 
 
 		 781 aa  791    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 783 aa  1607    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  59.49 
 
 		 772 aa  939    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 783 aa  1607    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  47.47 
 
 		 793 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  59.49 
 
 		 772 aa  939    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  63.35 
 
 		 773 aa  988    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  57.94 
 
 		 781 aa  895    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  57.72 
 
 		 785 aa  947    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  54.8 
 
 		 802 aa  855    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  47.98 
 
 		 773 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  54.74 
 
 		 788 aa  796    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  42.78 
 
 		 777 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  60.41 
 
 		 773 aa  905    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  58.86 
 
 		 785 aa  960    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  56.06 
 
 		 786 aa  885    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  34.99 
 
 		 773 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 756 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  36.49 
 
 		 749 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  31.57 
 
 		 757 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  35.12 
 
 		 759 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  35.12 
 
 		 759 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 		 766 aa  399  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  33.09 
 
 		 769 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.13 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  35.66 
 
 		 605 aa  257  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  32.84 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.79 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  37.12 
 
 		 852 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  37.91 
 
 		 831 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  37.91 
 
 		 805 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  37.41 
 
 		 842 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.2 
 
 		 532 aa  190  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 		 913 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  35.71 
 
 		 705 aa  184  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  32.6 
 
 		 519 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 		 1006 aa  183  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  33.9 
 
 		 607 aa  180  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  36 
 
 		 637 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 		 633 aa  172  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  36.68 
 
 		 689 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 		 636 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  35.93 
 
 		 614 aa  168  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  36.68 
 
 		 689 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  30.87 
 
 		 633 aa  163  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 		 631 aa  161  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  30.6 
 
 		 633 aa  160  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  35.49 
 
 		 612 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 		 677 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.54 
 
 		 618 aa  154  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  35.67 
 
 		 644 aa  153  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  34.11 
 
 		 618 aa  150  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  33.56 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  30.41 
 
 		 674 aa  147  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 		 624 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  35.62 
 
 		 638 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  33.22 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  35.92 
 
 		 612 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  35.56 
 
 		 612 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  29.59 
 
 		 647 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  34.64 
 
 		 576 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 647 aa  134  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  33.11 
 
 		 624 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  33.21 
 
 		 570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  33.11 
 
 		 624 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  31.54 
 
 		 564 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  30.85 
 
 		 570 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  30.85 
 
 		 570 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 		 570 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  33.69 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.82 
 
 		 510 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.82 
 
 		 510 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.82 
 
 		 510 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  29.12 
 
 		 510 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  31.58 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  32.76 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  29.93 
 
 		 612 aa  59.3  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  26.75 
 
 		 584 aa  51.2  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.26 
 
 		 678 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 638 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 634 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 		 335 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 		 335 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 		 335 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 		 572 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  22.33 
 
 		 520 aa  44.3  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>