87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3639 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 578 aa  1151    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  59.38 
 
 		 517 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  34.67 
 
 		 783 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 		 783 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  31.84 
 
 		 785 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 		 785 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  34.84 
 
 		 772 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  34.84 
 
 		 772 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  36.2 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  31.4 
 
 		 786 aa  216  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  33.87 
 
 		 769 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  33.89 
 
 		 610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 		 759 aa  210  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  33.79 
 
 		 759 aa  210  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 		 773 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  35.07 
 
 		 781 aa  205  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 781 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.83 
 
 		 777 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  29.65 
 
 		 802 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  32.87 
 
 		 766 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  36.54 
 
 		 519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  33.53 
 
 		 756 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 		 773 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  33.27 
 
 		 773 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  35.5 
 
 		 605 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.13 
 
 		 562 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 749 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  31.71 
 
 		 778 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  30.17 
 
 		 788 aa  194  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  31.71 
 
 		 773 aa  193  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  29 
 
 		 757 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  30.76 
 
 		 793 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  31.45 
 
 		 607 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  34.22 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  32.67 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  32.32 
 
 		 852 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  33 
 
 		 633 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  36.97 
 
 		 689 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 612 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  31.58 
 
 		 705 aa  139  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  35.25 
 
 		 624 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  36.97 
 
 		 689 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  33.44 
 
 		 612 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  33.9 
 
 		 612 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  34.48 
 
 		 647 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  34.23 
 
 		 677 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  34.12 
 
 		 831 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  34.12 
 
 		 805 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 		 842 aa  133  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 		 618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  31.05 
 
 		 645 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.21 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  31.71 
 
 		 633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 		 647 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  32.4 
 
 		 631 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  34.93 
 
 		 576 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  31.36 
 
 		 633 aa  127  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  31.54 
 
 		 637 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  32.07 
 
 		 913 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  32.62 
 
 		 636 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 		 1006 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  34.93 
 
 		 674 aa  120  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  30.86 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  31.92 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  34.12 
 
 		 624 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  34.12 
 
 		 624 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 570 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 570 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  32.42 
 
 		 644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  33.96 
 
 		 570 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  30.36 
 
 		 564 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  30.37 
 
 		 571 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  27.89 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  27.89 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  27.89 
 
 		 510 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 571 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 571 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.27 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 		 842 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  28.35 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 		 851 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 		 847 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1317  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 1017 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000794512  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.73 
 
 		 678 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>