100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1092 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  100 
 
 
756 aa  1565    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  50.6 
 
 
757 aa  808    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  69.37 
 
 
759 aa  1075    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  59.76 
 
 
766 aa  919    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  69.37 
 
 
759 aa  1075    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  56.78 
 
 
749 aa  839    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  76.62 
 
 
773 aa  1237    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  36.01 
 
 
781 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  36.52 
 
 
778 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.04 
 
 
772 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 
772 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  34.55 
 
 
773 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  34.51 
 
 
786 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 
793 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  31.88 
 
 
777 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  34.68 
 
 
785 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  34.18 
 
 
785 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  33.17 
 
 
802 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 
783 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  34.21 
 
 
783 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  34.37 
 
 
773 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  35.22 
 
 
743 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
773 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  33.88 
 
 
781 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 
788 aa  369  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  30 
 
 
769 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  33.45 
 
 
610 aa  226  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  38.16 
 
 
852 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  34.74 
 
 
842 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  37.04 
 
 
614 aa  184  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
578 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  28.27 
 
 
805 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 
831 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  36.3 
 
 
636 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.24 
 
 
618 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 
637 aa  174  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  31.04 
 
 
517 aa  174  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  34.01 
 
 
631 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  35.76 
 
 
674 aa  171  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 
633 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  34.34 
 
 
637 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  34.13 
 
 
633 aa  168  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  36.7 
 
 
624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  33.79 
 
 
633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 
605 aa  164  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  36.58 
 
 
612 aa  163  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  33.67 
 
 
705 aa  161  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  33.22 
 
 
644 aa  160  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  30.75 
 
 
1006 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  32.43 
 
 
689 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  33.66 
 
 
913 aa  154  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
689 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  33.22 
 
 
645 aa  151  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  34.02 
 
 
612 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  37.08 
 
 
618 aa  150  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  34.36 
 
 
612 aa  150  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  32.88 
 
 
638 aa  149  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  35.02 
 
 
624 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.02 
 
 
624 aa  148  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 
647 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 
650 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  34.95 
 
 
677 aa  147  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  31.1 
 
 
647 aa  144  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.26 
 
 
562 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 
570 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
576 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  28.8 
 
 
570 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 
570 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 
570 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  26.88 
 
 
519 aa  111  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  27.8 
 
 
564 aa  104  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 
510 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  28.76 
 
 
510 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  28.76 
 
 
510 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  28.76 
 
 
510 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.25 
 
 
510 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 
571 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 
571 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 
571 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  26.44 
 
 
552 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  23.12 
 
 
638 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  25.43 
 
 
582 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  25.38 
 
 
567 aa  50.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  25.43 
 
 
584 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
520 aa  47.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  23.42 
 
 
627 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  23.42 
 
 
627 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  24.48 
 
 
626 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.48 
 
 
626 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  24.48 
 
 
626 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  24.48 
 
 
627 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  24.48 
 
 
626 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  24.48 
 
 
626 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 
627 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.22 
 
 
598 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  23.76 
 
 
629 aa  45.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  25 
 
 
696 aa  44.3  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  23.42 
 
 
627 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>