100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3186 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  100 
 
 		 644 aa  1285    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  60.68 
 
 		 638 aa  703    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  50.08 
 
 		 650 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  47.14 
 
 		 624 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  48.44 
 
 		 624 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  47.67 
 
 		 624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  43.12 
 
 		 633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  43.12 
 
 		 633 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  43.06 
 
 		 636 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  41.94 
 
 		 633 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  44.15 
 
 		 645 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  43.23 
 
 		 647 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  42.46 
 
 		 631 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  46.56 
 
 		 637 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  37.46 
 
 		 637 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  36.86 
 
 		 607 aa  317  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  35.22 
 
 		 612 aa  306  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.77 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  40.61 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  37.08 
 
 		 612 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  36.77 
 
 		 612 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  34.77 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  29.97 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  38.63 
 
 		 689 aa  224  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  38.63 
 
 		 689 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  31.35 
 
 		 552 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  39.39 
 
 		 677 aa  173  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  35.47 
 
 		 674 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  35.99 
 
 		 705 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  34.93 
 
 		 759 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 		 759 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  37.67 
 
 		 743 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 		 756 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  34.33 
 
 		 786 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  34.46 
 
 		 773 aa  158  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  34.17 
 
 		 773 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  33.33 
 
 		 772 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 772 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  39.18 
 
 		 781 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 802 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  37.37 
 
 		 913 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.67 
 
 		 783 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.67 
 
 		 783 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  34.12 
 
 		 781 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  31.27 
 
 		 777 aa  152  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  37.08 
 
 		 766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 		 757 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  35.33 
 
 		 778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 		 773 aa  147  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  31.17 
 
 		 1006 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  30.65 
 
 		 785 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 793 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.68 
 
 		 773 aa  140  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 		 852 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  34.77 
 
 		 805 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  34.77 
 
 		 831 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  35.97 
 
 		 570 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  35.62 
 
 		 749 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  35.97 
 
 		 570 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  35.97 
 
 		 570 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  31.31 
 
 		 785 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  37.22 
 
 		 576 aa  133  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  34.87 
 
 		 842 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  32.46 
 
 		 564 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  33.67 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  35.59 
 
 		 769 aa  124  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 		 788 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  35.14 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.32 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.32 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.32 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  29.08 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.52 
 
 		 510 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.74 
 
 		 562 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  29.3 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  30.48 
 
 		 612 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.9 
 
 		 626 aa  53.9  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  30.9 
 
 		 626 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  30.9 
 
 		 626 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  30.9 
 
 		 626 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  30.9 
 
 		 626 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  30.9 
 
 		 627 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  30.9 
 
 		 627 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  30.9 
 
 		 627 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 		 627 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  30.9 
 
 		 627 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  30.9 
 
 		 627 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  28.05 
 
 		 628 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  28.05 
 
 		 628 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.12 
 
 		 678 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  36.84 
 
 		 629 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  32.35 
 
 		 628 aa  45.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>