83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3727 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
570 aa  1144    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
570 aa  1144    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  61.74 
 
 
570 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  98.42 
 
 
570 aa  1127    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  60.74 
 
 
576 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  36.11 
 
 
564 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 
571 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 
571 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 
571 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  36.11 
 
 
633 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  35.31 
 
 
633 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  34.41 
 
 
633 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  34.52 
 
 
637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  32.62 
 
 
636 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 
631 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  34.62 
 
 
644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  36.15 
 
 
638 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  35.17 
 
 
689 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 
689 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  30.03 
 
 
705 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  35.05 
 
 
781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  36 
 
 
769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  33.22 
 
 
614 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 
650 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 
773 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  33.77 
 
 
773 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  31.49 
 
 
647 aa  127  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  36.16 
 
 
674 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  32.59 
 
 
805 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 
783 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 
831 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  30.85 
 
 
783 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  30.48 
 
 
786 aa  124  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  30.5 
 
 
647 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 
852 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 
802 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  36.05 
 
 
624 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 
757 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
624 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 
624 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  37.14 
 
 
612 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  31.19 
 
 
677 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  29.49 
 
 
759 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  33.23 
 
 
645 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
759 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
756 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  29.97 
 
 
607 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  29.69 
 
 
785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  31.49 
 
 
743 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  36.07 
 
 
612 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  26.53 
 
 
773 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  28.91 
 
 
772 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  28.91 
 
 
772 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 
777 aa  114  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 
842 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 
637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 
773 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.13 
 
 
618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 
605 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  34.24 
 
 
749 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 
788 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  31.94 
 
 
793 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 
578 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  28.75 
 
 
1006 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 
913 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 
785 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 
766 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
510 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  30.48 
 
 
781 aa  103  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  33.23 
 
 
618 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
612 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  28.42 
 
 
510 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  28.42 
 
 
510 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  28.42 
 
 
510 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  29.97 
 
 
610 aa  97.4  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 
517 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  27.51 
 
 
510 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  29.25 
 
 
778 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.64 
 
 
562 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  31.64 
 
 
519 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  38.17 
 
 
532 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  29.94 
 
 
552 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  30.77 
 
 
592 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>