101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0626 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  98.2 
 
 
612 aa  1181    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  100 
 
 
612 aa  1197    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  49.28 
 
 
618 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  46.81 
 
 
607 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  48.53 
 
 
614 aa  485  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  46.57 
 
 
612 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  41.02 
 
 
647 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  46 
 
 
637 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  46.95 
 
 
618 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  36.81 
 
 
633 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  37.09 
 
 
633 aa  332  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  37.07 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  39.26 
 
 
552 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  37.09 
 
 
631 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  35.68 
 
 
636 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  35.96 
 
 
647 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  36.07 
 
 
624 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  38.06 
 
 
645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  37.56 
 
 
624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  36.79 
 
 
650 aa  303  9e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  37.94 
 
 
624 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  36.69 
 
 
644 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  35.21 
 
 
637 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  35.12 
 
 
638 aa  266  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  48.43 
 
 
689 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  47.76 
 
 
689 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  43.48 
 
 
677 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  38.28 
 
 
705 aa  193  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  37.25 
 
 
852 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  37.58 
 
 
842 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  39.94 
 
 
674 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  40.98 
 
 
831 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  41.58 
 
 
805 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  41.08 
 
 
781 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  36.18 
 
 
773 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  34.77 
 
 
756 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  37.79 
 
 
743 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  36.61 
 
 
773 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  35.53 
 
 
759 aa  167  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  35.53 
 
 
759 aa  167  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.93 
 
 
783 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.97 
 
 
772 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.93 
 
 
783 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.97 
 
 
772 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  32.55 
 
 
777 aa  163  8.000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  39.58 
 
 
1006 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  32.89 
 
 
773 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  30.42 
 
 
757 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  36.67 
 
 
781 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  33.22 
 
 
786 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  36.84 
 
 
766 aa  157  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
802 aa  157  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  31.35 
 
 
785 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  34.9 
 
 
913 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  30.65 
 
 
785 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  34.75 
 
 
778 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  34.47 
 
 
769 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 
788 aa  144  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  32 
 
 
773 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 
793 aa  141  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  34.08 
 
 
578 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  35.81 
 
 
570 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  35.81 
 
 
570 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  35.81 
 
 
570 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  36.14 
 
 
610 aa  133  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  36.56 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  35.74 
 
 
564 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
749 aa  128  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  35.83 
 
 
570 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  33.79 
 
 
517 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  36.63 
 
 
571 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  36.63 
 
 
571 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  36.63 
 
 
571 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  30.69 
 
 
510 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  30.69 
 
 
510 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.69 
 
 
510 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  29.66 
 
 
510 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31.86 
 
 
605 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.52 
 
 
510 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.48 
 
 
562 aa  87.8  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
638 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  30.27 
 
 
627 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  33.7 
 
 
532 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  30.27 
 
 
627 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  30.27 
 
 
627 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  30.27 
 
 
626 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.27 
 
 
626 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  30.27 
 
 
626 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  30.27 
 
 
626 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
627 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  30.27 
 
 
626 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  30.27 
 
 
627 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  31.31 
 
 
612 aa  60.5  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  27.34 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
634 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 
627 aa  57  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.62 
 
 
678 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  24.85 
 
 
629 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  26.55 
 
 
628 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  26.55 
 
 
628 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>