100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2683 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  100 
 
 
913 aa  1857    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 
1006 aa  207  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  36.61 
 
 
773 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  38.1 
 
 
705 aa  202  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  35.41 
 
 
783 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 
783 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  36.89 
 
 
781 aa  188  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  31.48 
 
 
777 aa  184  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 
852 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  31.99 
 
 
772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  31.99 
 
 
772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  30.67 
 
 
785 aa  181  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  31.09 
 
 
785 aa  181  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  34.68 
 
 
743 aa  180  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  27.28 
 
 
842 aa  174  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
773 aa  174  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  33.55 
 
 
778 aa  174  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  38.05 
 
 
638 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  37.41 
 
 
633 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  37.41 
 
 
633 aa  172  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  34.74 
 
 
773 aa  170  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  36.45 
 
 
766 aa  170  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  34.9 
 
 
781 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  35.22 
 
 
633 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  34.08 
 
 
759 aa  168  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  34.08 
 
 
759 aa  168  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  32.69 
 
 
802 aa  168  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  33.77 
 
 
757 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  32.37 
 
 
786 aa  167  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 
636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 
793 aa  165  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  37.67 
 
 
637 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  32.21 
 
 
773 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  36.61 
 
 
677 aa  162  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  37.11 
 
 
631 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  33.66 
 
 
756 aa  161  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  35.81 
 
 
689 aa  160  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  37.37 
 
 
644 aa  160  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  35.81 
 
 
689 aa  159  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  35.27 
 
 
637 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  35.31 
 
 
805 aa  158  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  35.31 
 
 
831 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  35.25 
 
 
624 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  32.45 
 
 
788 aa  153  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  39.06 
 
 
614 aa  151  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  34.64 
 
 
769 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  36.14 
 
 
674 aa  148  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.59 
 
 
624 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  35.59 
 
 
624 aa  146  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  34.36 
 
 
650 aa  141  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  35.23 
 
 
647 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  36.59 
 
 
645 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.65 
 
 
618 aa  137  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  33.59 
 
 
607 aa  134  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 
610 aa  134  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  33.91 
 
 
612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  32.28 
 
 
517 aa  130  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  34.26 
 
 
612 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  36.33 
 
 
612 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  30.94 
 
 
618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  33.77 
 
 
570 aa  119  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
605 aa  118  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
570 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.1 
 
 
510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.1 
 
 
510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  29.1 
 
 
510 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  32.55 
 
 
571 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  30.9 
 
 
576 aa  101  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  32.21 
 
 
571 aa  99  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  32.21 
 
 
571 aa  99  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  28.76 
 
 
510 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  28.9 
 
 
510 aa  97.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.27 
 
 
562 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  29.57 
 
 
552 aa  73.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 
532 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
634 aa  64.3  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  28.35 
 
 
612 aa  57  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
638 aa  55.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  27.23 
 
 
628 aa  53.5  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  27.23 
 
 
628 aa  53.5  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.23 
 
 
678 aa  51.2  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
627 aa  51.2  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  26.44 
 
 
627 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  28.21 
 
 
629 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  26.44 
 
 
627 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  26.29 
 
 
519 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  26.44 
 
 
626 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.44 
 
 
626 aa  48.9  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  26.44 
 
 
626 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  26.44 
 
 
626 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  26.44 
 
 
626 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
627 aa  47.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  25.88 
 
 
627 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  25.88 
 
 
627 aa  47  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>