96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2540 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  100 
 
 
634 aa  1307    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  53.76 
 
 
638 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  35.21 
 
 
627 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  35.63 
 
 
627 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  35.52 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.52 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  35.63 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  35.47 
 
 
627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  35.52 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  35.52 
 
 
626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  35.36 
 
 
626 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  35.68 
 
 
627 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  34.19 
 
 
627 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  32.33 
 
 
629 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  32.19 
 
 
628 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  32.19 
 
 
628 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  27.43 
 
 
612 aa  120  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.05 
 
 
678 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  29.31 
 
 
647 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  35.4 
 
 
610 aa  58.9  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  27.07 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
913 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  23.4 
 
 
647 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 
781 aa  56.2  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  25.59 
 
 
773 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 
757 aa  55.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 
842 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 
689 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  26.84 
 
 
563 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  24.94 
 
 
567 aa  55.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  22.46 
 
 
584 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  30 
 
 
650 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
689 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  29.1 
 
 
634 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 
636 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  27.73 
 
 
785 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  28.14 
 
 
705 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  25.33 
 
 
1006 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  28.71 
 
 
637 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  40.74 
 
 
645 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  33.06 
 
 
612 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  26.82 
 
 
785 aa  52  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  25.49 
 
 
852 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
607 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  24.3 
 
 
802 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  26.92 
 
 
743 aa  50.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  33.06 
 
 
612 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  22.4 
 
 
582 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.03 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 
773 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  38.82 
 
 
564 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  23.02 
 
 
759 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  23.02 
 
 
759 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.31 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.31 
 
 
635 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  26.94 
 
 
783 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.31 
 
 
635 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 
783 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 
631 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  39.05 
 
 
778 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  26.82 
 
 
786 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  22.22 
 
 
773 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  38.82 
 
 
571 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  38.82 
 
 
571 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.33 
 
 
633 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 
788 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  24.89 
 
 
624 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.44 
 
 
636 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  38.82 
 
 
571 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  25.33 
 
 
637 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  25.33 
 
 
633 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.92 
 
 
630 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 
618 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.45 
 
 
640 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  27.11 
 
 
578 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.33 
 
 
637 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.22 
 
 
620 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  29.25 
 
 
633 aa  45.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  26.09 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  28.41 
 
 
573 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.98 
 
 
644 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  29.66 
 
 
614 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  26.51 
 
 
574 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
572 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  26.5 
 
 
772 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 
772 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  34.17 
 
 
647 aa  44.3  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  34.65 
 
 
777 aa  44.3  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  30.19 
 
 
766 aa  43.9  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  28.37 
 
 
634 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.32 
 
 
622 aa  43.9  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.88 
 
 
638 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  39.71 
 
 
637 aa  43.9  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  24.23 
 
 
769 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.57 
 
 
645 aa  43.9  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>